Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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