Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vamp5Q9Z2P8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp5Q9Z2P8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp5Q9Z2P8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp5Q9Z2P8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp5Q9Z2P8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp5Q9Z2P8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp5Q9Z2P8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vamp5Q9Z2P8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp5Q9Z2P8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp5Q9Z2P8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vamp5Q9Z2P8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vamp5Q9Z2P8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp5Q9Z2P8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vamp5Q9Z2P8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp5Q9Z2P8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp5Q9Z2P8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp5Q9Z2P8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp5Q9Z2P8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vamp5Q9Z2P8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vamp5Q9Z2P8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vamp5Q9Z2P8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vamp5Q9Z2P8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp5Q9Z2P8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vamp5Q9Z2P8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vamp5Q9Z2P8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vamp5Q9Z2P8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vamp5Q9Z2P8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Vamp5Q9Z2P8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vamp5Q9Z2P8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Vamp5Q9Z2P8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Vamp5Q9Z2P8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Vamp5Q9Z2P8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Vamp5Q9Z2P8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vamp5Q9Z2P8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vamp5Q9Z2P8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vamp5Q9Z2P8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Vamp5Q9Z2P8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp5Q9Z2P8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp5Q9Z2P8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Vamp5Q9Z2P8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp5Q9Z2P8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp5Q9Z2P8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp5Q9Z2P8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vamp5Q9Z2P8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vamp5Q9Z2P8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp5Q9Z2P8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp5Q9Z2P8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vamp5Q9Z2P8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp5Q9Z2P8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Vamp5Q9Z2P8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp5Q9Z2P8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Vamp5Q9Z2P8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Vamp5Q9Z2P8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp5Q9Z2P8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp5Q9Z2P8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp5Q9Z2P8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vamp5Q9Z2P8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vamp5Q9Z2P8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Vamp5Q9Z2P8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Vamp5Q9Z2P8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Vamp5Q9Z2P8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vamp5Q9Z2P8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp5Q9Z2P8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp5Q9Z2P8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vamp5Q9Z2P8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Vamp5Q9Z2P8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vamp5Q9Z2P8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp5Q9Z2P8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp5Q9Z2P8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp5Q9Z2P8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp5Q9Z2P8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms