Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z138

Ror2, Tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror2Q9Z138 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ror2Q9Z138 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ror2Q9Z138 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ror2Q9Z138 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ror2Q9Z138 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ror2Q9Z138 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ror2Q9Z138 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ror2Q9Z138 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ror2Q9Z138 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ror2Q9Z138 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ror2Q9Z138 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ror2Q9Z138 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ror2Q9Z138 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ror2Q9Z138 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ror2Q9Z138 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ror2Q9Z138 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ror2Q9Z138 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ror2Q9Z138 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ror2Q9Z138 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ror2Q9Z138 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ror2Q9Z138 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ror2Q9Z138 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ror2Q9Z138 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ror2Q9Z138 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ror2Q9Z138 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ror2Q9Z138 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ror2Q9Z138 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ror2Q9Z138 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ror2Q9Z138 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ror2Q9Z138 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ror2Q9Z138 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ror2Q9Z138 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ror2Q9Z138 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ror2Q9Z138 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ror2Q9Z138 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ror2Q9Z138 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ror2Q9Z138 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ror2Q9Z138 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ror2Q9Z138 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ror2Q9Z138 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ror2Q9Z138 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ror2Q9Z138 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ror2Q9Z138 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ror2Q9Z138 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ror2Q9Z138 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ror2Q9Z138 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ror2Q9Z138 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ror2Q9Z138 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ror2Q9Z138 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ror2Q9Z138 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ror2Q9Z138 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ror2Q9Z138 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ror2Q9Z138 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ror2Q9Z138 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ror2Q9Z138 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ror2Q9Z138 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ror2Q9Z138 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ror2Q9Z138 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ror2Q9Z138 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ror2Q9Z138 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ror2Q9Z138 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ror2Q9Z138 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ror2Q9Z138 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ror2Q9Z138 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ror2Q9Z138 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ror2Q9Z138 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ror2Q9Z138 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ror2Q9Z138 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ror2Q9Z138 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ror2Q9Z138 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ror2Q9Z138 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ror2Q9Z138 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ror2Q9Z138 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ror2Q9Z138 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ror2Q9Z138 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ror2Q9Z138 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ror2Q9Z138 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ror2Q9Z138 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ror2Q9Z138 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ror2Q9Z138 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ror2Q9Z138 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ror2Q9Z138 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ror2Q9Z138 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ror2Q9Z138 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ror2Q9Z138 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ror2Q9Z138 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ror2Q9Z138 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ror2Q9Z138 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ror2Q9Z138 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ror2Q9Z138 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ror2Q9Z138 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ror2Q9Z138 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ror2Q9Z138 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ror2Q9Z138 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ror2Q9Z138 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ror2Q9Z138 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ror2Q9Z138 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ror2Q9Z138 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ror2Q9Z138 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ror2Q9Z138 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms