Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF7

Pole, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 2,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PoleQ9WVF7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PoleQ9WVF7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PoleQ9WVF7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PoleQ9WVF7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PoleQ9WVF7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PoleQ9WVF7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PoleQ9WVF7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PoleQ9WVF7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PoleQ9WVF7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PoleQ9WVF7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PoleQ9WVF7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PoleQ9WVF7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PoleQ9WVF7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PoleQ9WVF7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PoleQ9WVF7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PoleQ9WVF7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PoleQ9WVF7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PoleQ9WVF7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PoleQ9WVF7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PoleQ9WVF7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PoleQ9WVF7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PoleQ9WVF7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PoleQ9WVF7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PoleQ9WVF7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PoleQ9WVF7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PoleQ9WVF7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PoleQ9WVF7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PoleQ9WVF7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PoleQ9WVF7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PoleQ9WVF7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PoleQ9WVF7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PoleQ9WVF7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PoleQ9WVF7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PoleQ9WVF7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PoleQ9WVF7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PoleQ9WVF7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PoleQ9WVF7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PoleQ9WVF7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PoleQ9WVF7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PoleQ9WVF7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PoleQ9WVF7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PoleQ9WVF7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PoleQ9WVF7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PoleQ9WVF7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PoleQ9WVF7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PoleQ9WVF7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PoleQ9WVF7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PoleQ9WVF7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PoleQ9WVF7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PoleQ9WVF7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PoleQ9WVF7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PoleQ9WVF7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PoleQ9WVF7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PoleQ9WVF7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PoleQ9WVF7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PoleQ9WVF7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PoleQ9WVF7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PoleQ9WVF7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PoleQ9WVF7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PoleQ9WVF7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PoleQ9WVF7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PoleQ9WVF7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PoleQ9WVF7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PoleQ9WVF7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PoleQ9WVF7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PoleQ9WVF7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PoleQ9WVF7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PoleQ9WVF7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PoleQ9WVF7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PoleQ9WVF7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PoleQ9WVF7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PoleQ9WVF7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PoleQ9WVF7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PoleQ9WVF7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PoleQ9WVF7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PoleQ9WVF7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PoleQ9WVF7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PoleQ9WVF7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PoleQ9WVF7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PoleQ9WVF7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PoleQ9WVF7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PoleQ9WVF7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PoleQ9WVF7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms