Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pus1Q9WU56 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus1Q9WU56 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus1Q9WU56 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus1Q9WU56 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pus1Q9WU56 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus1Q9WU56 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus1Q9WU56 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus1Q9WU56 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pus1Q9WU56 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus1Q9WU56 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pus1Q9WU56 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus1Q9WU56 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pus1Q9WU56 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus1Q9WU56 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus1Q9WU56 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus1Q9WU56 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus1Q9WU56 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus1Q9WU56 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pus1Q9WU56 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pus1Q9WU56 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus1Q9WU56 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus1Q9WU56 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus1Q9WU56 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus1Q9WU56 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus1Q9WU56 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pus1Q9WU56 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pus1Q9WU56 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus1Q9WU56 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus1Q9WU56 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus1Q9WU56 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus1Q9WU56 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus1Q9WU56 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus1Q9WU56 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus1Q9WU56 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pus1Q9WU56 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pus1Q9WU56 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus1Q9WU56 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pus1Q9WU56 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus1Q9WU56 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pus1Q9WU56 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus1Q9WU56 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pus1Q9WU56 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pus1Q9WU56 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus1Q9WU56 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus1Q9WU56 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pus1Q9WU56 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pus1Q9WU56 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pus1Q9WU56 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pus1Q9WU56 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pus1Q9WU56 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pus1Q9WU56 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus1Q9WU56 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus1Q9WU56 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus1Q9WU56 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus1Q9WU56 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pus1Q9WU56 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus1Q9WU56 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus1Q9WU56 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus1Q9WU56 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus1Q9WU56 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus1Q9WU56 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus1Q9WU56 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pus1Q9WU56 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms