Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NbnQ9R207 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NbnQ9R207 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NbnQ9R207 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NbnQ9R207 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NbnQ9R207 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NbnQ9R207 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NbnQ9R207 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NbnQ9R207 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NbnQ9R207 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NbnQ9R207 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NbnQ9R207 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NbnQ9R207 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NbnQ9R207 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NbnQ9R207 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NbnQ9R207 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NbnQ9R207 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NbnQ9R207 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NbnQ9R207 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NbnQ9R207 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NbnQ9R207 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NbnQ9R207 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NbnQ9R207 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NbnQ9R207 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NbnQ9R207 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NbnQ9R207 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NbnQ9R207 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NbnQ9R207 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NbnQ9R207 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NbnQ9R207 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NbnQ9R207 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NbnQ9R207 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NbnQ9R207 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NbnQ9R207 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NbnQ9R207 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NbnQ9R207 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms