Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tk2Q9R088 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tk2Q9R088 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tk2Q9R088 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tk2Q9R088 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tk2Q9R088 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tk2Q9R088 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tk2Q9R088 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tk2Q9R088 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tk2Q9R088 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tk2Q9R088 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tk2Q9R088 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tk2Q9R088 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tk2Q9R088 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Tk2Q9R088 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tk2Q9R088 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tk2Q9R088 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tk2Q9R088 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tk2Q9R088 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tk2Q9R088 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tk2Q9R088 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tk2Q9R088 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tk2Q9R088 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tk2Q9R088 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tk2Q9R088 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tk2Q9R088 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tk2Q9R088 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tk2Q9R088 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tk2Q9R088 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tk2Q9R088 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tk2Q9R088 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tk2Q9R088 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tk2Q9R088 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tk2Q9R088 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tk2Q9R088 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tk2Q9R088 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tk2Q9R088 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tk2Q9R088 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tk2Q9R088 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tk2Q9R088 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tk2Q9R088 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tk2Q9R088 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tk2Q9R088 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tk2Q9R088 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tk2Q9R088 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tk2Q9R088 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tk2Q9R088 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tk2Q9R088 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tk2Q9R088 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tk2Q9R088 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tk2Q9R088 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tk2Q9R088 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tk2Q9R088 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tk2Q9R088 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tk2Q9R088 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tk2Q9R088 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tk2Q9R088 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tk2Q9R088 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tk2Q9R088 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tk2Q9R088 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tk2Q9R088 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tk2Q9R088 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tk2Q9R088 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tk2Q9R088 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tk2Q9R088 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tk2Q9R088 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tk2Q9R088 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tk2Q9R088 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tk2Q9R088 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tk2Q9R088 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tk2Q9R088 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tk2Q9R088 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tk2Q9R088 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tk2Q9R088 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tk2Q9R088 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tk2Q9R088 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tk2Q9R088 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tk2Q9R088 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tk2Q9R088 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tk2Q9R088 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tk2Q9R088 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms