Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Stx6Q9JKK1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Stx6Q9JKK1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Stx6Q9JKK1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Stx6Q9JKK1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Stx6Q9JKK1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Stx6Q9JKK1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Stx6Q9JKK1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Stx6Q9JKK1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Stx6Q9JKK1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Stx6Q9JKK1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Stx6Q9JKK1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Stx6Q9JKK1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Stx6Q9JKK1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Stx6Q9JKK1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Stx6Q9JKK1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Stx6Q9JKK1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Stx6Q9JKK1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Stx6Q9JKK1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Stx6Q9JKK1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stx6Q9JKK1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Stx6Q9JKK1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Stx6Q9JKK1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Stx6Q9JKK1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Stx6Q9JKK1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Stx6Q9JKK1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Stx6Q9JKK1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Stx6Q9JKK1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Stx6Q9JKK1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Stx6Q9JKK1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Stx6Q9JKK1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Stx6Q9JKK1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Stx6Q9JKK1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Stx6Q9JKK1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Stx6Q9JKK1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Stx6Q9JKK1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Stx6Q9JKK1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Stx6Q9JKK1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Stx6Q9JKK1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Stx6Q9JKK1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Stx6Q9JKK1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Stx6Q9JKK1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Stx6Q9JKK1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Stx6Q9JKK1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Stx6Q9JKK1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Stx6Q9JKK1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Stx6Q9JKK1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Stx6Q9JKK1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Stx6Q9JKK1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Stx6Q9JKK1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Stx6Q9JKK1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Stx6Q9JKK1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Stx6Q9JKK1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Stx6Q9JKK1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Stx6Q9JKK1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Stx6Q9JKK1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Stx6Q9JKK1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Stx6Q9JKK1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Stx6Q9JKK1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Stx6Q9JKK1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Stx6Q9JKK1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Stx6Q9JKK1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Stx6Q9JKK1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Stx6Q9JKK1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Stx6Q9JKK1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Stx6Q9JKK1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Stx6Q9JKK1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stx6Q9JKK1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Stx6Q9JKK1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Stx6Q9JKK1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Stx6Q9JKK1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Stx6Q9JKK1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Stx6Q9JKK1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stx6Q9JKK1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stx6Q9JKK1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stx6Q9JKK1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stx6Q9JKK1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stx6Q9JKK1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stx6Q9JKK1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stx6Q9JKK1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Stx6Q9JKK1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stx6Q9JKK1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stx6Q9JKK1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stx6Q9JKK1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stx6Q9JKK1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Stx6Q9JKK1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Stx6Q9JKK1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Stx6Q9JKK1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Stx6Q9JKK1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Stx6Q9JKK1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Stx6Q9JKK1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Stx6Q9JKK1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Stx6Q9JKK1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stx6Q9JKK1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Stx6Q9JKK1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stx6Q9JKK1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Stx6Q9JKK1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Stx6Q9JKK1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Stx6Q9JKK1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Stx6Q9JKK1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms