Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kcnq4Q9JK97 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kcnq4Q9JK97 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Kcnq4Q9JK97 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kcnq4Q9JK97 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kcnq4Q9JK97 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kcnq4Q9JK97 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kcnq4Q9JK97 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kcnq4Q9JK97 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kcnq4Q9JK97 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kcnq4Q9JK97 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kcnq4Q9JK97 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcnq4Q9JK97 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kcnq4Q9JK97 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kcnq4Q9JK97 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kcnq4Q9JK97 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kcnq4Q9JK97 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kcnq4Q9JK97 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kcnq4Q9JK97 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kcnq4Q9JK97 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kcnq4Q9JK97 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kcnq4Q9JK97 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kcnq4Q9JK97 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcnq4Q9JK97 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcnq4Q9JK97 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcnq4Q9JK97 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcnq4Q9JK97 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kcnq4Q9JK97 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Kcnq4Q9JK97 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kcnq4Q9JK97 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Kcnq4Q9JK97 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kcnq4Q9JK97 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kcnq4Q9JK97 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kcnq4Q9JK97 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kcnq4Q9JK97 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kcnq4Q9JK97 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kcnq4Q9JK97 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Kcnq4Q9JK97 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kcnq4Q9JK97 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kcnq4Q9JK97 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Kcnq4Q9JK97 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kcnq4Q9JK97 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kcnq4Q9JK97 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kcnq4Q9JK97 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kcnq4Q9JK97 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kcnq4Q9JK97 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Kcnq4Q9JK97 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kcnq4Q9JK97 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kcnq4Q9JK97 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kcnq4Q9JK97 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kcnq4Q9JK97 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kcnq4Q9JK97 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kcnq4Q9JK97 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kcnq4Q9JK97 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kcnq4Q9JK97 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kcnq4Q9JK97 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kcnq4Q9JK97 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kcnq4Q9JK97 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kcnq4Q9JK97 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kcnq4Q9JK97 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kcnq4Q9JK97 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kcnq4Q9JK97 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kcnq4Q9JK97 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kcnq4Q9JK97 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Kcnq4Q9JK97 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kcnq4Q9JK97 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kcnq4Q9JK97 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kcnq4Q9JK97 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kcnq4Q9JK97 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kcnq4Q9JK97 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kcnq4Q9JK97 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kcnq4Q9JK97 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kcnq4Q9JK97 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Kcnq4Q9JK97 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kcnq4Q9JK97 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Kcnq4Q9JK97 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Kcnq4Q9JK97 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kcnq4Q9JK97 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kcnq4Q9JK97 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kcnq4Q9JK97 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kcnq4Q9JK97 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcnq4Q9JK97 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kcnq4Q9JK97 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kcnq4Q9JK97 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kcnq4Q9JK97 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kcnq4Q9JK97 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kcnq4Q9JK97 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Kcnq4Q9JK97 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kcnq4Q9JK97 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kcnq4Q9JK97 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kcnq4Q9JK97 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnq4Q9JK97 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnq4Q9JK97 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kcnq4Q9JK97 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kcnq4Q9JK97 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kcnq4Q9JK97 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kcnq4Q9JK97 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kcnq4Q9JK97 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcnq4Q9JK97 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kcnq4Q9JK97 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms