Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIK5

Ddx21, Nucleolar RNA helicase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx21Q9JIK5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ddx21Q9JIK5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ddx21Q9JIK5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx21Q9JIK5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ddx21Q9JIK5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ddx21Q9JIK5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ddx21Q9JIK5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ddx21Q9JIK5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx21Q9JIK5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ddx21Q9JIK5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ddx21Q9JIK5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ddx21Q9JIK5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx21Q9JIK5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ddx21Q9JIK5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ddx21Q9JIK5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx21Q9JIK5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ddx21Q9JIK5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddx21Q9JIK5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ddx21Q9JIK5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ddx21Q9JIK5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ddx21Q9JIK5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddx21Q9JIK5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddx21Q9JIK5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddx21Q9JIK5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ddx21Q9JIK5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ddx21Q9JIK5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ddx21Q9JIK5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ddx21Q9JIK5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ddx21Q9JIK5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx21Q9JIK5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx21Q9JIK5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ddx21Q9JIK5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ddx21Q9JIK5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ddx21Q9JIK5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx21Q9JIK5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ddx21Q9JIK5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ddx21Q9JIK5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx21Q9JIK5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx21Q9JIK5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ddx21Q9JIK5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ddx21Q9JIK5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx21Q9JIK5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ddx21Q9JIK5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ddx21Q9JIK5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ddx21Q9JIK5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx21Q9JIK5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx21Q9JIK5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ddx21Q9JIK5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ddx21Q9JIK5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ddx21Q9JIK5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ddx21Q9JIK5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddx21Q9JIK5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ddx21Q9JIK5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ddx21Q9JIK5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ddx21Q9JIK5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx21Q9JIK5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ddx21Q9JIK5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddx21Q9JIK5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddx21Q9JIK5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddx21Q9JIK5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddx21Q9JIK5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ddx21Q9JIK5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ddx21Q9JIK5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ddx21Q9JIK5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx21Q9JIK5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx21Q9JIK5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddx21Q9JIK5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddx21Q9JIK5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddx21Q9JIK5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddx21Q9JIK5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ddx21Q9JIK5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddx21Q9JIK5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ddx21Q9JIK5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ddx21Q9JIK5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ddx21Q9JIK5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ddx21Q9JIK5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ddx21Q9JIK5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ddx21Q9JIK5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddx21Q9JIK5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddx21Q9JIK5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddx21Q9JIK5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddx21Q9JIK5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddx21Q9JIK5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddx21Q9JIK5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ddx21Q9JIK5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ddx21Q9JIK5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ddx21Q9JIK5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ddx21Q9JIK5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ddx21Q9JIK5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ddx21Q9JIK5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ddx21Q9JIK5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddx21Q9JIK5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ddx21Q9JIK5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ddx21Q9JIK5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ddx21Q9JIK5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ddx21Q9JIK5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ddx21Q9JIK5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ddx21Q9JIK5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ddx21Q9JIK5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ddx21Q9JIK5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms