Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIC3

Dclre1a, DNA cross-link repair 1A protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1aQ9JIC3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dclre1aQ9JIC3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dclre1aQ9JIC3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dclre1aQ9JIC3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dclre1aQ9JIC3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dclre1aQ9JIC3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dclre1aQ9JIC3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dclre1aQ9JIC3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Dclre1aQ9JIC3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Dclre1aQ9JIC3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dclre1aQ9JIC3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dclre1aQ9JIC3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dclre1aQ9JIC3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dclre1aQ9JIC3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dclre1aQ9JIC3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dclre1aQ9JIC3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dclre1aQ9JIC3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dclre1aQ9JIC3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dclre1aQ9JIC3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dclre1aQ9JIC3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dclre1aQ9JIC3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dclre1aQ9JIC3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dclre1aQ9JIC3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dclre1aQ9JIC3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dclre1aQ9JIC3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dclre1aQ9JIC3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dclre1aQ9JIC3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dclre1aQ9JIC3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dclre1aQ9JIC3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dclre1aQ9JIC3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dclre1aQ9JIC3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dclre1aQ9JIC3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Dclre1aQ9JIC3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dclre1aQ9JIC3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dclre1aQ9JIC3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dclre1aQ9JIC3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dclre1aQ9JIC3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dclre1aQ9JIC3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dclre1aQ9JIC3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dclre1aQ9JIC3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dclre1aQ9JIC3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dclre1aQ9JIC3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dclre1aQ9JIC3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dclre1aQ9JIC3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dclre1aQ9JIC3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dclre1aQ9JIC3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dclre1aQ9JIC3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dclre1aQ9JIC3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dclre1aQ9JIC3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dclre1aQ9JIC3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dclre1aQ9JIC3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Dclre1aQ9JIC3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dclre1aQ9JIC3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dclre1aQ9JIC3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dclre1aQ9JIC3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dclre1aQ9JIC3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dclre1aQ9JIC3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dclre1aQ9JIC3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dclre1aQ9JIC3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dclre1aQ9JIC3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dclre1aQ9JIC3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dclre1aQ9JIC3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dclre1aQ9JIC3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Dclre1aQ9JIC3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dclre1aQ9JIC3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dclre1aQ9JIC3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dclre1aQ9JIC3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dclre1aQ9JIC3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Dclre1aQ9JIC3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dclre1aQ9JIC3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dclre1aQ9JIC3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dclre1aQ9JIC3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dclre1aQ9JIC3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dclre1aQ9JIC3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dclre1aQ9JIC3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dclre1aQ9JIC3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dclre1aQ9JIC3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dclre1aQ9JIC3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dclre1aQ9JIC3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dclre1aQ9JIC3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dclre1aQ9JIC3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dclre1aQ9JIC3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dclre1aQ9JIC3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms