Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ropn1Q9ESG2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ropn1Q9ESG2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ropn1Q9ESG2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ropn1Q9ESG2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ropn1Q9ESG2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ropn1Q9ESG2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ropn1Q9ESG2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ropn1Q9ESG2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ropn1Q9ESG2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ropn1Q9ESG2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ropn1Q9ESG2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ropn1Q9ESG2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ropn1Q9ESG2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ropn1Q9ESG2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ropn1Q9ESG2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ropn1Q9ESG2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ropn1Q9ESG2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ropn1Q9ESG2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ropn1Q9ESG2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ropn1Q9ESG2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ropn1Q9ESG2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ropn1Q9ESG2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ropn1Q9ESG2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ropn1Q9ESG2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ropn1Q9ESG2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ropn1Q9ESG2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ropn1Q9ESG2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ropn1Q9ESG2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ropn1Q9ESG2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ropn1Q9ESG2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ropn1Q9ESG2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ropn1Q9ESG2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ropn1Q9ESG2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ropn1Q9ESG2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ropn1Q9ESG2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ropn1Q9ESG2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ropn1Q9ESG2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ropn1Q9ESG2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ropn1Q9ESG2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ropn1Q9ESG2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ropn1Q9ESG2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ropn1Q9ESG2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ropn1Q9ESG2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ropn1Q9ESG2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ropn1Q9ESG2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ropn1Q9ESG2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ropn1Q9ESG2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ropn1Q9ESG2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ropn1Q9ESG2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ropn1Q9ESG2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ropn1Q9ESG2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ropn1Q9ESG2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ropn1Q9ESG2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ropn1Q9ESG2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ropn1Q9ESG2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ropn1Q9ESG2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ropn1Q9ESG2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ropn1Q9ESG2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ropn1Q9ESG2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ropn1Q9ESG2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ropn1Q9ESG2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ropn1Q9ESG2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ropn1Q9ESG2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ropn1Q9ESG2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ropn1Q9ESG2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ropn1Q9ESG2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ropn1Q9ESG2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ropn1Q9ESG2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ropn1Q9ESG2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ropn1Q9ESG2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ropn1Q9ESG2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ropn1Q9ESG2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ropn1Q9ESG2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ropn1Q9ESG2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ropn1Q9ESG2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ropn1Q9ESG2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ropn1Q9ESG2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ropn1Q9ESG2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ropn1Q9ESG2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ropn1Q9ESG2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ropn1Q9ESG2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ropn1Q9ESG2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ropn1Q9ESG2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ropn1Q9ESG2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ropn1Q9ESG2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ropn1Q9ESG2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ropn1Q9ESG2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ropn1Q9ESG2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ropn1Q9ESG2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ropn1Q9ESG2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ropn1Q9ESG2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ropn1Q9ESG2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ropn1Q9ESG2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms