Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OtofQ9ESF1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OtofQ9ESF1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
OtofQ9ESF1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OtofQ9ESF1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OtofQ9ESF1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
OtofQ9ESF1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OtofQ9ESF1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
OtofQ9ESF1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OtofQ9ESF1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OtofQ9ESF1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OtofQ9ESF1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OtofQ9ESF1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OtofQ9ESF1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OtofQ9ESF1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
OtofQ9ESF1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
OtofQ9ESF1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OtofQ9ESF1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OtofQ9ESF1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OtofQ9ESF1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OtofQ9ESF1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OtofQ9ESF1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OtofQ9ESF1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
OtofQ9ESF1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OtofQ9ESF1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OtofQ9ESF1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
OtofQ9ESF1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
OtofQ9ESF1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
OtofQ9ESF1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OtofQ9ESF1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OtofQ9ESF1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
OtofQ9ESF1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
OtofQ9ESF1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OtofQ9ESF1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
OtofQ9ESF1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OtofQ9ESF1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OtofQ9ESF1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OtofQ9ESF1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OtofQ9ESF1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OtofQ9ESF1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OtofQ9ESF1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OtofQ9ESF1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OtofQ9ESF1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OtofQ9ESF1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OtofQ9ESF1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
OtofQ9ESF1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OtofQ9ESF1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OtofQ9ESF1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OtofQ9ESF1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
OtofQ9ESF1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OtofQ9ESF1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OtofQ9ESF1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OtofQ9ESF1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OtofQ9ESF1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
OtofQ9ESF1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
OtofQ9ESF1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
OtofQ9ESF1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
OtofQ9ESF1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
OtofQ9ESF1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
OtofQ9ESF1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OtofQ9ESF1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
OtofQ9ESF1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OtofQ9ESF1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OtofQ9ESF1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
OtofQ9ESF1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
OtofQ9ESF1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
OtofQ9ESF1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
OtofQ9ESF1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
OtofQ9ESF1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
OtofQ9ESF1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
OtofQ9ESF1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
OtofQ9ESF1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
OtofQ9ESF1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
OtofQ9ESF1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OtofQ9ESF1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
OtofQ9ESF1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
OtofQ9ESF1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
OtofQ9ESF1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OtofQ9ESF1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OtofQ9ESF1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
OtofQ9ESF1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OtofQ9ESF1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OtofQ9ESF1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OtofQ9ESF1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OtofQ9ESF1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
OtofQ9ESF1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OtofQ9ESF1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
OtofQ9ESF1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
OtofQ9ESF1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OtofQ9ESF1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OtofQ9ESF1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
OtofQ9ESF1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
OtofQ9ESF1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OtofQ9ESF1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OtofQ9ESF1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OtofQ9ESF1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OtofQ9ESF1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OtofQ9ESF1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms