Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc4Q9ES56 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc4Q9ES56 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc4Q9ES56 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc4Q9ES56 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc4Q9ES56 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc4Q9ES56 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc4Q9ES56 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc4Q9ES56 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc4Q9ES56 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc4Q9ES56 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc4Q9ES56 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc4Q9ES56 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc4Q9ES56 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc4Q9ES56 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc4Q9ES56 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc4Q9ES56 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc4Q9ES56 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc4Q9ES56 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc4Q9ES56 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc4Q9ES56 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc4Q9ES56 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc4Q9ES56 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc4Q9ES56 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc4Q9ES56 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc4Q9ES56 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc4Q9ES56 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc4Q9ES56 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc4Q9ES56 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc4Q9ES56 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc4Q9ES56 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc4Q9ES56 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc4Q9ES56 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc4Q9ES56 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc4Q9ES56 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc4Q9ES56 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc4Q9ES56 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc4Q9ES56 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc4Q9ES56 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc4Q9ES56 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc4Q9ES56 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc4Q9ES56 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc4Q9ES56 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc4Q9ES56 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc4Q9ES56 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc4Q9ES56 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc4Q9ES56 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc4Q9ES56 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc4Q9ES56 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc4Q9ES56 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc4Q9ES56 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc4Q9ES56 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc4Q9ES56 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc4Q9ES56 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc4Q9ES56 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc4Q9ES56 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc4Q9ES56 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc4Q9ES56 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc4Q9ES56 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc4Q9ES56 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc4Q9ES56 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc4Q9ES56 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc4Q9ES56 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc4Q9ES56 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc4Q9ES56 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc4Q9ES56 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc4Q9ES56 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc4Q9ES56 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc4Q9ES56 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc4Q9ES56 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc4Q9ES56 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc4Q9ES56 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc4Q9ES56 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc4Q9ES56 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc4Q9ES56 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc4Q9ES56 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc4Q9ES56 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc4Q9ES56 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc4Q9ES56 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc4Q9ES56 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trappc4Q9ES56 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc4Q9ES56 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trappc4Q9ES56 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc4Q9ES56 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc4Q9ES56 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trappc4Q9ES56 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trappc4Q9ES56 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc4Q9ES56 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trappc4Q9ES56 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc4Q9ES56 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trappc4Q9ES56 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc4Q9ES56 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trappc4Q9ES56 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc4Q9ES56 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc4Q9ES56 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trappc4Q9ES56 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc4Q9ES56 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trappc4Q9ES56 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc4Q9ES56 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trappc4Q9ES56 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms