Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atg7Q9D906 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Atg7Q9D906 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atg7Q9D906 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atg7Q9D906 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atg7Q9D906 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atg7Q9D906 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atg7Q9D906 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atg7Q9D906 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atg7Q9D906 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atg7Q9D906 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atg7Q9D906 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atg7Q9D906 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atg7Q9D906 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atg7Q9D906 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atg7Q9D906 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atg7Q9D906 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Atg7Q9D906 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atg7Q9D906 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atg7Q9D906 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atg7Q9D906 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atg7Q9D906 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Atg7Q9D906 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atg7Q9D906 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atg7Q9D906 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atg7Q9D906 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atg7Q9D906 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atg7Q9D906 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atg7Q9D906 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atg7Q9D906 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atg7Q9D906 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atg7Q9D906 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg7Q9D906 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg7Q9D906 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg7Q9D906 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg7Q9D906 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg7Q9D906 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg7Q9D906 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atg7Q9D906 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atg7Q9D906 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atg7Q9D906 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atg7Q9D906 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atg7Q9D906 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atg7Q9D906 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atg7Q9D906 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atg7Q9D906 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Atg7Q9D906 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atg7Q9D906 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg7Q9D906 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atg7Q9D906 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atg7Q9D906 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg7Q9D906 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg7Q9D906 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg7Q9D906 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg7Q9D906 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg7Q9D906 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg7Q9D906 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg7Q9D906 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg7Q9D906 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg7Q9D906 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg7Q9D906 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg7Q9D906 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg7Q9D906 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg7Q9D906 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg7Q9D906 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg7Q9D906 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg7Q9D906 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atg7Q9D906 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg7Q9D906 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atg7Q9D906 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Atg7Q9D906 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg7Q9D906 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg7Q9D906 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atg7Q9D906 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atg7Q9D906 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg7Q9D906 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atg7Q9D906 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atg7Q9D906 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atg7Q9D906 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg7Q9D906 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg7Q9D906 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atg7Q9D906 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg7Q9D906 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg7Q9D906 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atg7Q9D906 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atg7Q9D906 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atg7Q9D906 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg7Q9D906 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Atg7Q9D906 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg7Q9D906 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atg7Q9D906 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg7Q9D906 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg7Q9D906 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg7Q9D906 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg7Q9D906 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atg7Q9D906 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atg7Q9D906 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atg7Q9D906 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atg7Q9D906 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Atg7Q9D906 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms