Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifrd2Q9D8U0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ifrd2Q9D8U0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifrd2Q9D8U0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifrd2Q9D8U0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ifrd2Q9D8U0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ifrd2Q9D8U0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifrd2Q9D8U0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ifrd2Q9D8U0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ifrd2Q9D8U0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ifrd2Q9D8U0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ifrd2Q9D8U0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ifrd2Q9D8U0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifrd2Q9D8U0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ifrd2Q9D8U0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifrd2Q9D8U0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ifrd2Q9D8U0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifrd2Q9D8U0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ifrd2Q9D8U0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ifrd2Q9D8U0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ifrd2Q9D8U0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ifrd2Q9D8U0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ifrd2Q9D8U0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ifrd2Q9D8U0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ifrd2Q9D8U0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifrd2Q9D8U0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ifrd2Q9D8U0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ifrd2Q9D8U0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifrd2Q9D8U0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifrd2Q9D8U0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ifrd2Q9D8U0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ifrd2Q9D8U0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifrd2Q9D8U0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifrd2Q9D8U0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ifrd2Q9D8U0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ifrd2Q9D8U0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifrd2Q9D8U0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ifrd2Q9D8U0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifrd2Q9D8U0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifrd2Q9D8U0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifrd2Q9D8U0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifrd2Q9D8U0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ifrd2Q9D8U0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifrd2Q9D8U0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ifrd2Q9D8U0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ifrd2Q9D8U0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifrd2Q9D8U0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ifrd2Q9D8U0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifrd2Q9D8U0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifrd2Q9D8U0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ifrd2Q9D8U0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifrd2Q9D8U0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifrd2Q9D8U0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifrd2Q9D8U0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ifrd2Q9D8U0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifrd2Q9D8U0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifrd2Q9D8U0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifrd2Q9D8U0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifrd2Q9D8U0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ifrd2Q9D8U0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ifrd2Q9D8U0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ifrd2Q9D8U0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifrd2Q9D8U0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ifrd2Q9D8U0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ifrd2Q9D8U0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifrd2Q9D8U0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifrd2Q9D8U0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifrd2Q9D8U0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifrd2Q9D8U0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifrd2Q9D8U0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifrd2Q9D8U0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifrd2Q9D8U0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifrd2Q9D8U0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifrd2Q9D8U0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifrd2Q9D8U0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifrd2Q9D8U0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifrd2Q9D8U0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifrd2Q9D8U0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifrd2Q9D8U0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifrd2Q9D8U0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifrd2Q9D8U0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifrd2Q9D8U0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifrd2Q9D8U0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifrd2Q9D8U0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifrd2Q9D8U0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifrd2Q9D8U0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifrd2Q9D8U0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifrd2Q9D8U0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifrd2Q9D8U0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifrd2Q9D8U0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifrd2Q9D8U0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifrd2Q9D8U0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifrd2Q9D8U0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifrd2Q9D8U0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifrd2Q9D8U0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifrd2Q9D8U0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifrd2Q9D8U0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifrd2Q9D8U0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifrd2Q9D8U0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifrd2Q9D8U0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms