Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nsmce1Q9D720 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nsmce1Q9D720 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nsmce1Q9D720 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nsmce1Q9D720 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nsmce1Q9D720 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nsmce1Q9D720 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nsmce1Q9D720 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nsmce1Q9D720 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nsmce1Q9D720 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nsmce1Q9D720 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nsmce1Q9D720 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nsmce1Q9D720 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nsmce1Q9D720 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nsmce1Q9D720 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Nsmce1Q9D720 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nsmce1Q9D720 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nsmce1Q9D720 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nsmce1Q9D720 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nsmce1Q9D720 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nsmce1Q9D720 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nsmce1Q9D720 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nsmce1Q9D720 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nsmce1Q9D720 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nsmce1Q9D720 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nsmce1Q9D720 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nsmce1Q9D720 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nsmce1Q9D720 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nsmce1Q9D720 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nsmce1Q9D720 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nsmce1Q9D720 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nsmce1Q9D720 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nsmce1Q9D720 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nsmce1Q9D720 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nsmce1Q9D720 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nsmce1Q9D720 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nsmce1Q9D720 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nsmce1Q9D720 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nsmce1Q9D720 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nsmce1Q9D720 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nsmce1Q9D720 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nsmce1Q9D720 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nsmce1Q9D720 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nsmce1Q9D720 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nsmce1Q9D720 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nsmce1Q9D720 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nsmce1Q9D720 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nsmce1Q9D720 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nsmce1Q9D720 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nsmce1Q9D720 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nsmce1Q9D720 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nsmce1Q9D720 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nsmce1Q9D720 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nsmce1Q9D720 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nsmce1Q9D720 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Nsmce1Q9D720 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nsmce1Q9D720 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nsmce1Q9D720 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nsmce1Q9D720 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nsmce1Q9D720 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nsmce1Q9D720 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nsmce1Q9D720 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nsmce1Q9D720 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nsmce1Q9D720 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nsmce1Q9D720 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nsmce1Q9D720 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nsmce1Q9D720 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nsmce1Q9D720 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nsmce1Q9D720 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nsmce1Q9D720 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nsmce1Q9D720 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nsmce1Q9D720 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nsmce1Q9D720 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nsmce1Q9D720 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nsmce1Q9D720 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nsmce1Q9D720 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nsmce1Q9D720 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nsmce1Q9D720 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nsmce1Q9D720 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nsmce1Q9D720 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nsmce1Q9D720 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nsmce1Q9D720 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Nsmce1Q9D720 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nsmce1Q9D720 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nsmce1Q9D720 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nsmce1Q9D720 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nsmce1Q9D720 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nsmce1Q9D720 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nsmce1Q9D720 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nsmce1Q9D720 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nsmce1Q9D720 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nsmce1Q9D720 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nsmce1Q9D720 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nsmce1Q9D720 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nsmce1Q9D720 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nsmce1Q9D720 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nsmce1Q9D720 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nsmce1Q9D720 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nsmce1Q9D720 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nsmce1Q9D720 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms