Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6N1

Ca13, Carbonic anhydrase 13, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca13Q9D6N1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ca13Q9D6N1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ca13Q9D6N1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ca13Q9D6N1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ca13Q9D6N1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ca13Q9D6N1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ca13Q9D6N1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ca13Q9D6N1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ca13Q9D6N1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ca13Q9D6N1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ca13Q9D6N1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ca13Q9D6N1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ca13Q9D6N1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ca13Q9D6N1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ca13Q9D6N1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ca13Q9D6N1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ca13Q9D6N1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ca13Q9D6N1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ca13Q9D6N1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ca13Q9D6N1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ca13Q9D6N1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ca13Q9D6N1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ca13Q9D6N1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ca13Q9D6N1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ca13Q9D6N1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ca13Q9D6N1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ca13Q9D6N1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ca13Q9D6N1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ca13Q9D6N1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ca13Q9D6N1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ca13Q9D6N1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ca13Q9D6N1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ca13Q9D6N1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ca13Q9D6N1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ca13Q9D6N1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ca13Q9D6N1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ca13Q9D6N1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ca13Q9D6N1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ca13Q9D6N1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ca13Q9D6N1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ca13Q9D6N1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ca13Q9D6N1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ca13Q9D6N1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ca13Q9D6N1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ca13Q9D6N1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ca13Q9D6N1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ca13Q9D6N1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ca13Q9D6N1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ca13Q9D6N1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ca13Q9D6N1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ca13Q9D6N1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ca13Q9D6N1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ca13Q9D6N1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ca13Q9D6N1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ca13Q9D6N1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ca13Q9D6N1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ca13Q9D6N1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ca13Q9D6N1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ca13Q9D6N1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ca13Q9D6N1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ca13Q9D6N1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ca13Q9D6N1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ca13Q9D6N1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ca13Q9D6N1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ca13Q9D6N1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ca13Q9D6N1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ca13Q9D6N1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ca13Q9D6N1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ca13Q9D6N1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ca13Q9D6N1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ca13Q9D6N1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ca13Q9D6N1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ca13Q9D6N1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ca13Q9D6N1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ca13Q9D6N1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ca13Q9D6N1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ca13Q9D6N1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ca13Q9D6N1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ca13Q9D6N1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ca13Q9D6N1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca13Q9D6N1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ca13Q9D6N1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ca13Q9D6N1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ca13Q9D6N1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ca13Q9D6N1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ca13Q9D6N1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ca13Q9D6N1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ca13Q9D6N1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ca13Q9D6N1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ca13Q9D6N1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ca13Q9D6N1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ca13Q9D6N1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca13Q9D6N1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca13Q9D6N1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca13Q9D6N1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca13Q9D6N1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca13Q9D6N1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca13Q9D6N1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ca13Q9D6N1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ca13Q9D6N1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms