Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PudpQ9D5U5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PudpQ9D5U5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PudpQ9D5U5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PudpQ9D5U5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PudpQ9D5U5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PudpQ9D5U5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PudpQ9D5U5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PudpQ9D5U5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PudpQ9D5U5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PudpQ9D5U5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PudpQ9D5U5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PudpQ9D5U5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PudpQ9D5U5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PudpQ9D5U5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PudpQ9D5U5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PudpQ9D5U5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PudpQ9D5U5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PudpQ9D5U5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PudpQ9D5U5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PudpQ9D5U5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PudpQ9D5U5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PudpQ9D5U5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PudpQ9D5U5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PudpQ9D5U5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PudpQ9D5U5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PudpQ9D5U5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PudpQ9D5U5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PudpQ9D5U5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PudpQ9D5U5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PudpQ9D5U5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PudpQ9D5U5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PudpQ9D5U5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PudpQ9D5U5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PudpQ9D5U5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PudpQ9D5U5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PudpQ9D5U5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PudpQ9D5U5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PudpQ9D5U5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PudpQ9D5U5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PudpQ9D5U5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PudpQ9D5U5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PudpQ9D5U5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PudpQ9D5U5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PudpQ9D5U5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PudpQ9D5U5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PudpQ9D5U5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PudpQ9D5U5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PudpQ9D5U5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PudpQ9D5U5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PudpQ9D5U5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PudpQ9D5U5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PudpQ9D5U5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PudpQ9D5U5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PudpQ9D5U5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PudpQ9D5U5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PudpQ9D5U5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PudpQ9D5U5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PudpQ9D5U5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PudpQ9D5U5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PudpQ9D5U5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PudpQ9D5U5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PudpQ9D5U5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PudpQ9D5U5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PudpQ9D5U5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PudpQ9D5U5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PudpQ9D5U5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PudpQ9D5U5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PudpQ9D5U5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PudpQ9D5U5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PudpQ9D5U5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PudpQ9D5U5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PudpQ9D5U5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PudpQ9D5U5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PudpQ9D5U5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PudpQ9D5U5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PudpQ9D5U5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PudpQ9D5U5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PudpQ9D5U5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PudpQ9D5U5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PudpQ9D5U5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PudpQ9D5U5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PudpQ9D5U5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PudpQ9D5U5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PudpQ9D5U5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PudpQ9D5U5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PudpQ9D5U5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PudpQ9D5U5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PudpQ9D5U5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PudpQ9D5U5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PudpQ9D5U5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PudpQ9D5U5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PudpQ9D5U5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PudpQ9D5U5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PudpQ9D5U5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PudpQ9D5U5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PudpQ9D5U5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PudpQ9D5U5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PudpQ9D5U5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PudpQ9D5U5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms