Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5R4

Spata1, Spermatogenesis-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata1Q9D5R4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Spata1Q9D5R4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Spata1Q9D5R4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spata1Q9D5R4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Spata1Q9D5R4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spata1Q9D5R4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Spata1Q9D5R4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spata1Q9D5R4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Spata1Q9D5R4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Spata1Q9D5R4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Spata1Q9D5R4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spata1Q9D5R4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Spata1Q9D5R4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spata1Q9D5R4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Spata1Q9D5R4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Spata1Q9D5R4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spata1Q9D5R4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Spata1Q9D5R4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spata1Q9D5R4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spata1Q9D5R4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spata1Q9D5R4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spata1Q9D5R4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spata1Q9D5R4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spata1Q9D5R4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spata1Q9D5R4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Spata1Q9D5R4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spata1Q9D5R4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spata1Q9D5R4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spata1Q9D5R4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spata1Q9D5R4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spata1Q9D5R4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spata1Q9D5R4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spata1Q9D5R4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spata1Q9D5R4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spata1Q9D5R4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spata1Q9D5R4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spata1Q9D5R4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spata1Q9D5R4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spata1Q9D5R4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spata1Q9D5R4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spata1Q9D5R4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spata1Q9D5R4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spata1Q9D5R4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spata1Q9D5R4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spata1Q9D5R4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spata1Q9D5R4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spata1Q9D5R4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spata1Q9D5R4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spata1Q9D5R4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spata1Q9D5R4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spata1Q9D5R4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spata1Q9D5R4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spata1Q9D5R4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spata1Q9D5R4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms