Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zc2hc1bQ9D534 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zc2hc1bQ9D534 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zc2hc1bQ9D534 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zc2hc1bQ9D534 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zc2hc1bQ9D534 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zc2hc1bQ9D534 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zc2hc1bQ9D534 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zc2hc1bQ9D534 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zc2hc1bQ9D534 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zc2hc1bQ9D534 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zc2hc1bQ9D534 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zc2hc1bQ9D534 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zc2hc1bQ9D534 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zc2hc1bQ9D534 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zc2hc1bQ9D534 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zc2hc1bQ9D534 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zc2hc1bQ9D534 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc2hc1bQ9D534 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zc2hc1bQ9D534 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc2hc1bQ9D534 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc2hc1bQ9D534 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zc2hc1bQ9D534 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc2hc1bQ9D534 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zc2hc1bQ9D534 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc2hc1bQ9D534 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zc2hc1bQ9D534 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Zc2hc1bQ9D534 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zc2hc1bQ9D534 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zc2hc1bQ9D534 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zc2hc1bQ9D534 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zc2hc1bQ9D534 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zc2hc1bQ9D534 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zc2hc1bQ9D534 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zc2hc1bQ9D534 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zc2hc1bQ9D534 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Zc2hc1bQ9D534 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zc2hc1bQ9D534 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zc2hc1bQ9D534 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zc2hc1bQ9D534 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Zc2hc1bQ9D534 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zc2hc1bQ9D534 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zc2hc1bQ9D534 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zc2hc1bQ9D534 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zc2hc1bQ9D534 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zc2hc1bQ9D534 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zc2hc1bQ9D534 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zc2hc1bQ9D534 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zc2hc1bQ9D534 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zc2hc1bQ9D534 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zc2hc1bQ9D534 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zc2hc1bQ9D534 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zc2hc1bQ9D534 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zc2hc1bQ9D534 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zc2hc1bQ9D534 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zc2hc1bQ9D534 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zc2hc1bQ9D534 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zc2hc1bQ9D534 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zc2hc1bQ9D534 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zc2hc1bQ9D534 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zc2hc1bQ9D534 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zc2hc1bQ9D534 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zc2hc1bQ9D534 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zc2hc1bQ9D534 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zc2hc1bQ9D534 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zc2hc1bQ9D534 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zc2hc1bQ9D534 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zc2hc1bQ9D534 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zc2hc1bQ9D534 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc2hc1bQ9D534 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.2 ms