Protein–RNA interactions for Protein: Q9D187

Fam96b, Mitotic spindle-associated MMXD complex subunit MIP18, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam96bQ9D187 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam96bQ9D187 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam96bQ9D187 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam96bQ9D187 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam96bQ9D187 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam96bQ9D187 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam96bQ9D187 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam96bQ9D187 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms