Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem53Q9D0Z3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem53Q9D0Z3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmem53Q9D0Z3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem53Q9D0Z3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmem53Q9D0Z3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem53Q9D0Z3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem53Q9D0Z3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem53Q9D0Z3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem53Q9D0Z3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem53Q9D0Z3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem53Q9D0Z3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem53Q9D0Z3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem53Q9D0Z3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem53Q9D0Z3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem53Q9D0Z3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem53Q9D0Z3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem53Q9D0Z3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem53Q9D0Z3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem53Q9D0Z3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem53Q9D0Z3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem53Q9D0Z3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem53Q9D0Z3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem53Q9D0Z3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem53Q9D0Z3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem53Q9D0Z3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem53Q9D0Z3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem53Q9D0Z3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmem53Q9D0Z3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem53Q9D0Z3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem53Q9D0Z3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem53Q9D0Z3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem53Q9D0Z3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem53Q9D0Z3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem53Q9D0Z3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem53Q9D0Z3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem53Q9D0Z3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem53Q9D0Z3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem53Q9D0Z3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem53Q9D0Z3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem53Q9D0Z3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem53Q9D0Z3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem53Q9D0Z3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmem53Q9D0Z3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmem53Q9D0Z3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem53Q9D0Z3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem53Q9D0Z3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem53Q9D0Z3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem53Q9D0Z3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem53Q9D0Z3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem53Q9D0Z3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem53Q9D0Z3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem53Q9D0Z3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmem53Q9D0Z3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem53Q9D0Z3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem53Q9D0Z3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem53Q9D0Z3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem53Q9D0Z3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem53Q9D0Z3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem53Q9D0Z3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem53Q9D0Z3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem53Q9D0Z3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem53Q9D0Z3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem53Q9D0Z3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem53Q9D0Z3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem53Q9D0Z3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem53Q9D0Z3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem53Q9D0Z3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem53Q9D0Z3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem53Q9D0Z3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem53Q9D0Z3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem53Q9D0Z3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem53Q9D0Z3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem53Q9D0Z3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem53Q9D0Z3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem53Q9D0Z3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem53Q9D0Z3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmem53Q9D0Z3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem53Q9D0Z3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms