Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B0

Srsf9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf9Q9D0B0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srsf9Q9D0B0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Srsf9Q9D0B0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Srsf9Q9D0B0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf9Q9D0B0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf9Q9D0B0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf9Q9D0B0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Srsf9Q9D0B0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf9Q9D0B0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Srsf9Q9D0B0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf9Q9D0B0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Srsf9Q9D0B0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Srsf9Q9D0B0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Srsf9Q9D0B0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf9Q9D0B0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Srsf9Q9D0B0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf9Q9D0B0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf9Q9D0B0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf9Q9D0B0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf9Q9D0B0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf9Q9D0B0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf9Q9D0B0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Srsf9Q9D0B0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf9Q9D0B0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Srsf9Q9D0B0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf9Q9D0B0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Srsf9Q9D0B0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf9Q9D0B0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf9Q9D0B0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Srsf9Q9D0B0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Srsf9Q9D0B0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srsf9Q9D0B0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Srsf9Q9D0B0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf9Q9D0B0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf9Q9D0B0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Srsf9Q9D0B0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf9Q9D0B0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf9Q9D0B0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Srsf9Q9D0B0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf9Q9D0B0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Srsf9Q9D0B0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Srsf9Q9D0B0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Srsf9Q9D0B0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf9Q9D0B0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Srsf9Q9D0B0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Srsf9Q9D0B0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf9Q9D0B0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Srsf9Q9D0B0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 299.2 ms