Protein–RNA interactions for Protein: Q9D099

Acer3, Alkaline ceramidase 3, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acer3Q9D099 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Acer3Q9D099 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Acer3Q9D099 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Acer3Q9D099 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Acer3Q9D099 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Acer3Q9D099 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Acer3Q9D099 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Acer3Q9D099 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Acer3Q9D099 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Acer3Q9D099 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Acer3Q9D099 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Acer3Q9D099 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Acer3Q9D099 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Acer3Q9D099 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Acer3Q9D099 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Acer3Q9D099 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Acer3Q9D099 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Acer3Q9D099 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Acer3Q9D099 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Acer3Q9D099 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Acer3Q9D099 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acer3Q9D099 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acer3Q9D099 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acer3Q9D099 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acer3Q9D099 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Acer3Q9D099 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Acer3Q9D099 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Acer3Q9D099 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Acer3Q9D099 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Acer3Q9D099 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Acer3Q9D099 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acer3Q9D099 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acer3Q9D099 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acer3Q9D099 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acer3Q9D099 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Acer3Q9D099 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Acer3Q9D099 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Acer3Q9D099 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Acer3Q9D099 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Acer3Q9D099 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acer3Q9D099 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Acer3Q9D099 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acer3Q9D099 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acer3Q9D099 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Acer3Q9D099 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Acer3Q9D099 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acer3Q9D099 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Acer3Q9D099 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acer3Q9D099 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acer3Q9D099 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acer3Q9D099 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acer3Q9D099 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acer3Q9D099 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Acer3Q9D099 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acer3Q9D099 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Acer3Q9D099 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Acer3Q9D099 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acer3Q9D099 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acer3Q9D099 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acer3Q9D099 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acer3Q9D099 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Acer3Q9D099 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Acer3Q9D099 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Acer3Q9D099 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Acer3Q9D099 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Acer3Q9D099 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Acer3Q9D099 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Acer3Q9D099 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Acer3Q9D099 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Acer3Q9D099 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Acer3Q9D099 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Acer3Q9D099 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Acer3Q9D099 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Acer3Q9D099 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Acer3Q9D099 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Acer3Q9D099 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Acer3Q9D099 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Acer3Q9D099 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Acer3Q9D099 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Acer3Q9D099 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Acer3Q9D099 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177 ms