Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR8

Tsfm, Elongation factor Ts, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsfmQ9CZR8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TsfmQ9CZR8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TsfmQ9CZR8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TsfmQ9CZR8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsfmQ9CZR8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsfmQ9CZR8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TsfmQ9CZR8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TsfmQ9CZR8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TsfmQ9CZR8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TsfmQ9CZR8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TsfmQ9CZR8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TsfmQ9CZR8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TsfmQ9CZR8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TsfmQ9CZR8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TsfmQ9CZR8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TsfmQ9CZR8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TsfmQ9CZR8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TsfmQ9CZR8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TsfmQ9CZR8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TsfmQ9CZR8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TsfmQ9CZR8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TsfmQ9CZR8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TsfmQ9CZR8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TsfmQ9CZR8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TsfmQ9CZR8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TsfmQ9CZR8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TsfmQ9CZR8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TsfmQ9CZR8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TsfmQ9CZR8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TsfmQ9CZR8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TsfmQ9CZR8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TsfmQ9CZR8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TsfmQ9CZR8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TsfmQ9CZR8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TsfmQ9CZR8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TsfmQ9CZR8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TsfmQ9CZR8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TsfmQ9CZR8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TsfmQ9CZR8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TsfmQ9CZR8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TsfmQ9CZR8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TsfmQ9CZR8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TsfmQ9CZR8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsfmQ9CZR8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsfmQ9CZR8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsfmQ9CZR8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsfmQ9CZR8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsfmQ9CZR8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TsfmQ9CZR8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TsfmQ9CZR8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TsfmQ9CZR8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TsfmQ9CZR8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TsfmQ9CZR8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TsfmQ9CZR8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TsfmQ9CZR8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TsfmQ9CZR8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TsfmQ9CZR8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TsfmQ9CZR8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsfmQ9CZR8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TsfmQ9CZR8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TsfmQ9CZR8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TsfmQ9CZR8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TsfmQ9CZR8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TsfmQ9CZR8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TsfmQ9CZR8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TsfmQ9CZR8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TsfmQ9CZR8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TsfmQ9CZR8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TsfmQ9CZR8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TsfmQ9CZR8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TsfmQ9CZR8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TsfmQ9CZR8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TsfmQ9CZR8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TsfmQ9CZR8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TsfmQ9CZR8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TsfmQ9CZR8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TsfmQ9CZR8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TsfmQ9CZR8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TsfmQ9CZR8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TsfmQ9CZR8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TsfmQ9CZR8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TsfmQ9CZR8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TsfmQ9CZR8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TsfmQ9CZR8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TsfmQ9CZR8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TsfmQ9CZR8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TsfmQ9CZR8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TsfmQ9CZR8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TsfmQ9CZR8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TsfmQ9CZR8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TsfmQ9CZR8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TsfmQ9CZR8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TsfmQ9CZR8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TsfmQ9CZR8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TsfmQ9CZR8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsfmQ9CZR8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsfmQ9CZR8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsfmQ9CZR8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TsfmQ9CZR8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TsfmQ9CZR8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms