Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXS4

Cenpv, Centromere protein V, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpvQ9CXS4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpvQ9CXS4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpvQ9CXS4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpvQ9CXS4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpvQ9CXS4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpvQ9CXS4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpvQ9CXS4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpvQ9CXS4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpvQ9CXS4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CenpvQ9CXS4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpvQ9CXS4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpvQ9CXS4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CenpvQ9CXS4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CenpvQ9CXS4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpvQ9CXS4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CenpvQ9CXS4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpvQ9CXS4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CenpvQ9CXS4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpvQ9CXS4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpvQ9CXS4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CenpvQ9CXS4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CenpvQ9CXS4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpvQ9CXS4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpvQ9CXS4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CenpvQ9CXS4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CenpvQ9CXS4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CenpvQ9CXS4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpvQ9CXS4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CenpvQ9CXS4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CenpvQ9CXS4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CenpvQ9CXS4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpvQ9CXS4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpvQ9CXS4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpvQ9CXS4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CenpvQ9CXS4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CenpvQ9CXS4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpvQ9CXS4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpvQ9CXS4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CenpvQ9CXS4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CenpvQ9CXS4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpvQ9CXS4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpvQ9CXS4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpvQ9CXS4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpvQ9CXS4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CenpvQ9CXS4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CenpvQ9CXS4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CenpvQ9CXS4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpvQ9CXS4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CenpvQ9CXS4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpvQ9CXS4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CenpvQ9CXS4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpvQ9CXS4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpvQ9CXS4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpvQ9CXS4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpvQ9CXS4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CenpvQ9CXS4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CenpvQ9CXS4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CenpvQ9CXS4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpvQ9CXS4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpvQ9CXS4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CenpvQ9CXS4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpvQ9CXS4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpvQ9CXS4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpvQ9CXS4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpvQ9CXS4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CenpvQ9CXS4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CenpvQ9CXS4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CenpvQ9CXS4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpvQ9CXS4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CenpvQ9CXS4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CenpvQ9CXS4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CenpvQ9CXS4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpvQ9CXS4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpvQ9CXS4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpvQ9CXS4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpvQ9CXS4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CenpvQ9CXS4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CenpvQ9CXS4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CenpvQ9CXS4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CenpvQ9CXS4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CenpvQ9CXS4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpvQ9CXS4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpvQ9CXS4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpvQ9CXS4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpvQ9CXS4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CenpvQ9CXS4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpvQ9CXS4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpvQ9CXS4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpvQ9CXS4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CenpvQ9CXS4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpvQ9CXS4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CenpvQ9CXS4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CenpvQ9CXS4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CenpvQ9CXS4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpvQ9CXS4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpvQ9CXS4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpvQ9CXS4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpvQ9CXS4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpvQ9CXS4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpvQ9CXS4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms