Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd4Q9CWX4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd4Q9CWX4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rpusd4Q9CWX4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd4Q9CWX4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd4Q9CWX4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rpusd4Q9CWX4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rpusd4Q9CWX4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd4Q9CWX4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd4Q9CWX4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd4Q9CWX4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpusd4Q9CWX4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpusd4Q9CWX4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd4Q9CWX4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd4Q9CWX4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd4Q9CWX4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpusd4Q9CWX4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpusd4Q9CWX4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd4Q9CWX4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd4Q9CWX4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpusd4Q9CWX4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpusd4Q9CWX4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpusd4Q9CWX4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd4Q9CWX4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpusd4Q9CWX4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd4Q9CWX4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd4Q9CWX4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpusd4Q9CWX4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpusd4Q9CWX4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpusd4Q9CWX4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd4Q9CWX4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd4Q9CWX4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd4Q9CWX4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpusd4Q9CWX4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rpusd4Q9CWX4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd4Q9CWX4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rpusd4Q9CWX4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd4Q9CWX4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd4Q9CWX4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd4Q9CWX4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rpusd4Q9CWX4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd4Q9CWX4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd4Q9CWX4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rpusd4Q9CWX4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd4Q9CWX4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rpusd4Q9CWX4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd4Q9CWX4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rpusd4Q9CWX4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd4Q9CWX4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd4Q9CWX4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rpusd4Q9CWX4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd4Q9CWX4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd4Q9CWX4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd4Q9CWX4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd4Q9CWX4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rpusd4Q9CWX4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd4Q9CWX4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rpusd4Q9CWX4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd4Q9CWX4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd4Q9CWX4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rpusd4Q9CWX4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rpusd4Q9CWX4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd4Q9CWX4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rpusd4Q9CWX4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rpusd4Q9CWX4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rpusd4Q9CWX4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpusd4Q9CWX4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpusd4Q9CWX4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rpusd4Q9CWX4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd4Q9CWX4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rpusd4Q9CWX4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd4Q9CWX4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rpusd4Q9CWX4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpusd4Q9CWX4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms