Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS74

Ecd, Protein ecdysoneless homolog, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EcdQ9CS74 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EcdQ9CS74 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EcdQ9CS74 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EcdQ9CS74 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EcdQ9CS74 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EcdQ9CS74 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EcdQ9CS74 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EcdQ9CS74 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EcdQ9CS74 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EcdQ9CS74 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EcdQ9CS74 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EcdQ9CS74 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EcdQ9CS74 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EcdQ9CS74 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EcdQ9CS74 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EcdQ9CS74 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EcdQ9CS74 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EcdQ9CS74 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EcdQ9CS74 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EcdQ9CS74 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EcdQ9CS74 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EcdQ9CS74 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EcdQ9CS74 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EcdQ9CS74 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EcdQ9CS74 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EcdQ9CS74 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EcdQ9CS74 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EcdQ9CS74 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EcdQ9CS74 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EcdQ9CS74 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EcdQ9CS74 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EcdQ9CS74 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EcdQ9CS74 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EcdQ9CS74 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EcdQ9CS74 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EcdQ9CS74 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EcdQ9CS74 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EcdQ9CS74 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EcdQ9CS74 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EcdQ9CS74 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EcdQ9CS74 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EcdQ9CS74 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EcdQ9CS74 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EcdQ9CS74 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EcdQ9CS74 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EcdQ9CS74 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EcdQ9CS74 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EcdQ9CS74 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EcdQ9CS74 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EcdQ9CS74 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EcdQ9CS74 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EcdQ9CS74 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EcdQ9CS74 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EcdQ9CS74 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EcdQ9CS74 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EcdQ9CS74 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EcdQ9CS74 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EcdQ9CS74 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EcdQ9CS74 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EcdQ9CS74 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EcdQ9CS74 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EcdQ9CS74 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EcdQ9CS74 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EcdQ9CS74 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EcdQ9CS74 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EcdQ9CS74 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EcdQ9CS74 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EcdQ9CS74 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EcdQ9CS74 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EcdQ9CS74 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EcdQ9CS74 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EcdQ9CS74 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EcdQ9CS74 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EcdQ9CS74 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EcdQ9CS74 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EcdQ9CS74 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EcdQ9CS74 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EcdQ9CS74 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EcdQ9CS74 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EcdQ9CS74 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EcdQ9CS74 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EcdQ9CS74 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EcdQ9CS74 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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