Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ska2Q9CR46 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ska2Q9CR46 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ska2Q9CR46 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ska2Q9CR46 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ska2Q9CR46 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ska2Q9CR46 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ska2Q9CR46 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ska2Q9CR46 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ska2Q9CR46 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ska2Q9CR46 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ska2Q9CR46 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ska2Q9CR46 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ska2Q9CR46 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ska2Q9CR46 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ska2Q9CR46 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ska2Q9CR46 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ska2Q9CR46 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ska2Q9CR46 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ska2Q9CR46 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ska2Q9CR46 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ska2Q9CR46 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ska2Q9CR46 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ska2Q9CR46 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ska2Q9CR46 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ska2Q9CR46 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ska2Q9CR46 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ska2Q9CR46 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ska2Q9CR46 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ska2Q9CR46 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ska2Q9CR46 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ska2Q9CR46 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ska2Q9CR46 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ska2Q9CR46 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ska2Q9CR46 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ska2Q9CR46 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ska2Q9CR46 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ska2Q9CR46 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ska2Q9CR46 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ska2Q9CR46 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ska2Q9CR46 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ska2Q9CR46 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ska2Q9CR46 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ska2Q9CR46 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ska2Q9CR46 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ska2Q9CR46 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ska2Q9CR46 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ska2Q9CR46 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ska2Q9CR46 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ska2Q9CR46 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ska2Q9CR46 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ska2Q9CR46 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ska2Q9CR46 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ska2Q9CR46 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ska2Q9CR46 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ska2Q9CR46 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ska2Q9CR46 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ska2Q9CR46 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ska2Q9CR46 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ska2Q9CR46 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ska2Q9CR46 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ska2Q9CR46 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ska2Q9CR46 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ska2Q9CR46 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ska2Q9CR46 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ska2Q9CR46 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ska2Q9CR46 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ska2Q9CR46 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ska2Q9CR46 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ska2Q9CR46 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ska2Q9CR46 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ska2Q9CR46 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ska2Q9CR46 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ska2Q9CR46 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ska2Q9CR46 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ska2Q9CR46 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ska2Q9CR46 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ska2Q9CR46 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ska2Q9CR46 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ska2Q9CR46 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ska2Q9CR46 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ska2Q9CR46 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ska2Q9CR46 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ska2Q9CR46 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ska2Q9CR46 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ska2Q9CR46 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ska2Q9CR46 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ska2Q9CR46 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ska2Q9CR46 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ska2Q9CR46 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ska2Q9CR46 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ska2Q9CR46 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ska2Q9CR46 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ska2Q9CR46 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ska2Q9CR46 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ska2Q9CR46 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ska2Q9CR46 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ska2Q9CR46 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ska2Q9CR46 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ska2Q9CR46 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms