Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR35

Ctrb1, Chymotrypsinogen B, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctrb1Q9CR35 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctrb1Q9CR35 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctrb1Q9CR35 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctrb1Q9CR35 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctrb1Q9CR35 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctrb1Q9CR35 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctrb1Q9CR35 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctrb1Q9CR35 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctrb1Q9CR35 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctrb1Q9CR35 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctrb1Q9CR35 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctrb1Q9CR35 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms