Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Polr3kQ9CQZ7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Polr3kQ9CQZ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Polr3kQ9CQZ7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Polr3kQ9CQZ7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Polr3kQ9CQZ7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr3kQ9CQZ7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr3kQ9CQZ7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Polr3kQ9CQZ7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Polr3kQ9CQZ7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr3kQ9CQZ7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr3kQ9CQZ7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr3kQ9CQZ7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr3kQ9CQZ7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr3kQ9CQZ7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr3kQ9CQZ7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr3kQ9CQZ7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr3kQ9CQZ7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr3kQ9CQZ7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr3kQ9CQZ7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr3kQ9CQZ7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr3kQ9CQZ7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr3kQ9CQZ7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr3kQ9CQZ7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr3kQ9CQZ7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr3kQ9CQZ7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr3kQ9CQZ7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr3kQ9CQZ7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr3kQ9CQZ7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr3kQ9CQZ7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr3kQ9CQZ7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Polr3kQ9CQZ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr3kQ9CQZ7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Polr3kQ9CQZ7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr3kQ9CQZ7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr3kQ9CQZ7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr3kQ9CQZ7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr3kQ9CQZ7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr3kQ9CQZ7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Polr3kQ9CQZ7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Polr3kQ9CQZ7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Polr3kQ9CQZ7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Polr3kQ9CQZ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Polr3kQ9CQZ7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Polr3kQ9CQZ7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Polr3kQ9CQZ7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Polr3kQ9CQZ7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Polr3kQ9CQZ7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Polr3kQ9CQZ7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Polr3kQ9CQZ7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Polr3kQ9CQZ7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Polr3kQ9CQZ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Polr3kQ9CQZ7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Polr3kQ9CQZ7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Polr3kQ9CQZ7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Polr3kQ9CQZ7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Polr3kQ9CQZ7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Polr3kQ9CQZ7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Polr3kQ9CQZ7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Polr3kQ9CQZ7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Polr3kQ9CQZ7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Polr3kQ9CQZ7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Polr3kQ9CQZ7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Polr3kQ9CQZ7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Polr3kQ9CQZ7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr3kQ9CQZ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr3kQ9CQZ7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr3kQ9CQZ7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr3kQ9CQZ7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr3kQ9CQZ7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr3kQ9CQZ7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr3kQ9CQZ7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr3kQ9CQZ7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Polr3kQ9CQZ7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr3kQ9CQZ7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms