Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itgb3bpQ9CQ82 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb3bpQ9CQ82 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itgb3bpQ9CQ82 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itgb3bpQ9CQ82 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb3bpQ9CQ82 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb3bpQ9CQ82 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb3bpQ9CQ82 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb3bpQ9CQ82 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb3bpQ9CQ82 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb3bpQ9CQ82 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Itgb3bpQ9CQ82 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb3bpQ9CQ82 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb3bpQ9CQ82 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb3bpQ9CQ82 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb3bpQ9CQ82 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb3bpQ9CQ82 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb3bpQ9CQ82 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb3bpQ9CQ82 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb3bpQ9CQ82 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb3bpQ9CQ82 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb3bpQ9CQ82 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb3bpQ9CQ82 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb3bpQ9CQ82 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb3bpQ9CQ82 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb3bpQ9CQ82 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb3bpQ9CQ82 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb3bpQ9CQ82 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb3bpQ9CQ82 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb3bpQ9CQ82 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb3bpQ9CQ82 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb3bpQ9CQ82 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb3bpQ9CQ82 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb3bpQ9CQ82 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb3bpQ9CQ82 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Itgb3bpQ9CQ82 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Itgb3bpQ9CQ82 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Itgb3bpQ9CQ82 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb3bpQ9CQ82 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Itgb3bpQ9CQ82 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb3bpQ9CQ82 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Itgb3bpQ9CQ82 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb3bpQ9CQ82 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Itgb3bpQ9CQ82 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb3bpQ9CQ82 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb3bpQ9CQ82 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Itgb3bpQ9CQ82 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb3bpQ9CQ82 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb3bpQ9CQ82 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb3bpQ9CQ82 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Itgb3bpQ9CQ82 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb3bpQ9CQ82 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb3bpQ9CQ82 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itgb3bpQ9CQ82 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itgb3bpQ9CQ82 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb3bpQ9CQ82 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itgb3bpQ9CQ82 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb3bpQ9CQ82 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb3bpQ9CQ82 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb3bpQ9CQ82 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itgb3bpQ9CQ82 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb3bpQ9CQ82 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb3bpQ9CQ82 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb3bpQ9CQ82 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itgb3bpQ9CQ82 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb3bpQ9CQ82 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itgb3bpQ9CQ82 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb3bpQ9CQ82 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itgb3bpQ9CQ82 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb3bpQ9CQ82 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb3bpQ9CQ82 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb3bpQ9CQ82 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itgb3bpQ9CQ82 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itgb3bpQ9CQ82 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb3bpQ9CQ82 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb3bpQ9CQ82 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb3bpQ9CQ82 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itgb3bpQ9CQ82 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb3bpQ9CQ82 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itgb3bpQ9CQ82 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb3bpQ9CQ82 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb3bpQ9CQ82 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb3bpQ9CQ82 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb3bpQ9CQ82 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb3bpQ9CQ82 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb3bpQ9CQ82 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itgb3bpQ9CQ82 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb3bpQ9CQ82 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itgb3bpQ9CQ82 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itgb3bpQ9CQ82 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms