Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ79

Txndc9, Thioredoxin domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc9Q9CQ79 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Txndc9Q9CQ79 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Txndc9Q9CQ79 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Txndc9Q9CQ79 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Txndc9Q9CQ79 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Txndc9Q9CQ79 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Txndc9Q9CQ79 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Txndc9Q9CQ79 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Txndc9Q9CQ79 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Txndc9Q9CQ79 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Txndc9Q9CQ79 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Txndc9Q9CQ79 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Txndc9Q9CQ79 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Txndc9Q9CQ79 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Txndc9Q9CQ79 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Txndc9Q9CQ79 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Txndc9Q9CQ79 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Txndc9Q9CQ79 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Txndc9Q9CQ79 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Txndc9Q9CQ79 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Txndc9Q9CQ79 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Txndc9Q9CQ79 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Txndc9Q9CQ79 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Txndc9Q9CQ79 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Txndc9Q9CQ79 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Txndc9Q9CQ79 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Txndc9Q9CQ79 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Txndc9Q9CQ79 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Txndc9Q9CQ79 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Txndc9Q9CQ79 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Txndc9Q9CQ79 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Txndc9Q9CQ79 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Txndc9Q9CQ79 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Txndc9Q9CQ79 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Txndc9Q9CQ79 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Txndc9Q9CQ79 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Txndc9Q9CQ79 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Txndc9Q9CQ79 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Txndc9Q9CQ79 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Txndc9Q9CQ79 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Txndc9Q9CQ79 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Txndc9Q9CQ79 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Txndc9Q9CQ79 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Txndc9Q9CQ79 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Txndc9Q9CQ79 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Txndc9Q9CQ79 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Txndc9Q9CQ79 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Txndc9Q9CQ79 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Txndc9Q9CQ79 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Txndc9Q9CQ79 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Txndc9Q9CQ79 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Txndc9Q9CQ79 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Txndc9Q9CQ79 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Txndc9Q9CQ79 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Txndc9Q9CQ79 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Txndc9Q9CQ79 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Txndc9Q9CQ79 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Txndc9Q9CQ79 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Txndc9Q9CQ79 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Txndc9Q9CQ79 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Txndc9Q9CQ79 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Txndc9Q9CQ79 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Txndc9Q9CQ79 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Txndc9Q9CQ79 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Txndc9Q9CQ79 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Txndc9Q9CQ79 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Txndc9Q9CQ79 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Txndc9Q9CQ79 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Txndc9Q9CQ79 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Txndc9Q9CQ79 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Txndc9Q9CQ79 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Txndc9Q9CQ79 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Txndc9Q9CQ79 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Txndc9Q9CQ79 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Txndc9Q9CQ79 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Txndc9Q9CQ79 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Txndc9Q9CQ79 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Txndc9Q9CQ79 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Txndc9Q9CQ79 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Txndc9Q9CQ79 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Txndc9Q9CQ79 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms