Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc198Q9CPZ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc198Q9CPZ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc198Q9CPZ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc198Q9CPZ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc198Q9CPZ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc198Q9CPZ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc198Q9CPZ1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc198Q9CPZ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc198Q9CPZ1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc198Q9CPZ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc198Q9CPZ1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc198Q9CPZ1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc198Q9CPZ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc198Q9CPZ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc198Q9CPZ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc198Q9CPZ1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc198Q9CPZ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc198Q9CPZ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc198Q9CPZ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc198Q9CPZ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc198Q9CPZ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc198Q9CPZ1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc198Q9CPZ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc198Q9CPZ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc198Q9CPZ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc198Q9CPZ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc198Q9CPZ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc198Q9CPZ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc198Q9CPZ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc198Q9CPZ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc198Q9CPZ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc198Q9CPZ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc198Q9CPZ1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc198Q9CPZ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc198Q9CPZ1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc198Q9CPZ1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc198Q9CPZ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc198Q9CPZ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc198Q9CPZ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc198Q9CPZ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc198Q9CPZ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc198Q9CPZ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc198Q9CPZ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc198Q9CPZ1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc198Q9CPZ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc198Q9CPZ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc198Q9CPZ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc198Q9CPZ1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc198Q9CPZ1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc198Q9CPZ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc198Q9CPZ1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc198Q9CPZ1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc198Q9CPZ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc198Q9CPZ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc198Q9CPZ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc198Q9CPZ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc198Q9CPZ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc198Q9CPZ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc198Q9CPZ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc198Q9CPZ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc198Q9CPZ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc198Q9CPZ1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc198Q9CPZ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc198Q9CPZ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc198Q9CPZ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc198Q9CPZ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc198Q9CPZ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms