Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gtf2a1Q99PM3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtf2a1Q99PM3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gtf2a1Q99PM3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gtf2a1Q99PM3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gtf2a1Q99PM3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf2a1Q99PM3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gtf2a1Q99PM3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtf2a1Q99PM3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gtf2a1Q99PM3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gtf2a1Q99PM3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gtf2a1Q99PM3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Gtf2a1Q99PM3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtf2a1Q99PM3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gtf2a1Q99PM3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gtf2a1Q99PM3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Gtf2a1Q99PM3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gtf2a1Q99PM3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gtf2a1Q99PM3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gtf2a1Q99PM3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gtf2a1Q99PM3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gtf2a1Q99PM3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gtf2a1Q99PM3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf2a1Q99PM3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf2a1Q99PM3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gtf2a1Q99PM3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gtf2a1Q99PM3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gtf2a1Q99PM3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gtf2a1Q99PM3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gtf2a1Q99PM3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gtf2a1Q99PM3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gtf2a1Q99PM3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2a1Q99PM3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2a1Q99PM3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2a1Q99PM3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2a1Q99PM3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2a1Q99PM3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2a1Q99PM3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gtf2a1Q99PM3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gtf2a1Q99PM3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gtf2a1Q99PM3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf2a1Q99PM3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gtf2a1Q99PM3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtf2a1Q99PM3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gtf2a1Q99PM3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2a1Q99PM3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2a1Q99PM3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2a1Q99PM3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gtf2a1Q99PM3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gtf2a1Q99PM3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gtf2a1Q99PM3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtf2a1Q99PM3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gtf2a1Q99PM3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gtf2a1Q99PM3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf2a1Q99PM3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gtf2a1Q99PM3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gtf2a1Q99PM3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtf2a1Q99PM3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gtf2a1Q99PM3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gtf2a1Q99PM3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gtf2a1Q99PM3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gtf2a1Q99PM3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtf2a1Q99PM3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtf2a1Q99PM3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gtf2a1Q99PM3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf2a1Q99PM3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gtf2a1Q99PM3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gtf2a1Q99PM3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf2a1Q99PM3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf2a1Q99PM3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf2a1Q99PM3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gtf2a1Q99PM3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gtf2a1Q99PM3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Gtf2a1Q99PM3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2a1Q99PM3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2a1Q99PM3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2a1Q99PM3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2a1Q99PM3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf2a1Q99PM3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms