Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Bco2Q99NF1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Bco2Q99NF1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Bco2Q99NF1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Bco2Q99NF1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Bco2Q99NF1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Bco2Q99NF1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Bco2Q99NF1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Bco2Q99NF1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Bco2Q99NF1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Bco2Q99NF1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Bco2Q99NF1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Bco2Q99NF1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Bco2Q99NF1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Bco2Q99NF1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Bco2Q99NF1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Bco2Q99NF1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Bco2Q99NF1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Bco2Q99NF1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Bco2Q99NF1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Bco2Q99NF1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Bco2Q99NF1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Bco2Q99NF1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Bco2Q99NF1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Bco2Q99NF1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Bco2Q99NF1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Bco2Q99NF1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Bco2Q99NF1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Bco2Q99NF1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Bco2Q99NF1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bco2Q99NF1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Bco2Q99NF1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Bco2Q99NF1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Bco2Q99NF1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Bco2Q99NF1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Bco2Q99NF1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Bco2Q99NF1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Bco2Q99NF1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Bco2Q99NF1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Bco2Q99NF1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Bco2Q99NF1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Bco2Q99NF1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Bco2Q99NF1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Bco2Q99NF1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Bco2Q99NF1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bco2Q99NF1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Bco2Q99NF1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Bco2Q99NF1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Bco2Q99NF1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Bco2Q99NF1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Bco2Q99NF1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Bco2Q99NF1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Bco2Q99NF1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Bco2Q99NF1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Bco2Q99NF1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Bco2Q99NF1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Bco2Q99NF1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Bco2Q99NF1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Bco2Q99NF1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Bco2Q99NF1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Bco2Q99NF1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Bco2Q99NF1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Bco2Q99NF1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Bco2Q99NF1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Bco2Q99NF1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Bco2Q99NF1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Bco2Q99NF1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Bco2Q99NF1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Bco2Q99NF1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Bco2Q99NF1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Bco2Q99NF1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Bco2Q99NF1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Bco2Q99NF1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Bco2Q99NF1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Bco2Q99NF1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Bco2Q99NF1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Bco2Q99NF1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Bco2Q99NF1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Bco2Q99NF1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Bco2Q99NF1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Bco2Q99NF1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Bco2Q99NF1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Bco2Q99NF1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Bco2Q99NF1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Bco2Q99NF1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Bco2Q99NF1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Bco2Q99NF1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Bco2Q99NF1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Bco2Q99NF1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Bco2Q99NF1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Bco2Q99NF1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Bco2Q99NF1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Bco2Q99NF1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Bco2Q99NF1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Bco2Q99NF1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Bco2Q99NF1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Bco2Q99NF1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Bco2Q99NF1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Bco2Q99NF1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Bco2Q99NF1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
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