Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rims1Q99NE5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rims1Q99NE5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Rims1Q99NE5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rims1Q99NE5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rims1Q99NE5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rims1Q99NE5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rims1Q99NE5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rims1Q99NE5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rims1Q99NE5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rims1Q99NE5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rims1Q99NE5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rims1Q99NE5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rims1Q99NE5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rims1Q99NE5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rims1Q99NE5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rims1Q99NE5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rims1Q99NE5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Rims1Q99NE5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rims1Q99NE5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rims1Q99NE5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rims1Q99NE5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rims1Q99NE5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Rims1Q99NE5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Rims1Q99NE5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rims1Q99NE5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rims1Q99NE5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rims1Q99NE5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Rims1Q99NE5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rims1Q99NE5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Rims1Q99NE5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rims1Q99NE5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rims1Q99NE5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rims1Q99NE5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rims1Q99NE5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rims1Q99NE5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rims1Q99NE5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rims1Q99NE5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rims1Q99NE5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rims1Q99NE5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rims1Q99NE5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rims1Q99NE5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Rims1Q99NE5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rims1Q99NE5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rims1Q99NE5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rims1Q99NE5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rims1Q99NE5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rims1Q99NE5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Rims1Q99NE5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rims1Q99NE5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rims1Q99NE5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rims1Q99NE5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rims1Q99NE5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rims1Q99NE5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rims1Q99NE5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rims1Q99NE5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rims1Q99NE5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Rims1Q99NE5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rims1Q99NE5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rims1Q99NE5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rims1Q99NE5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rims1Q99NE5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rims1Q99NE5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rims1Q99NE5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rims1Q99NE5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rims1Q99NE5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rims1Q99NE5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rims1Q99NE5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Rims1Q99NE5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rims1Q99NE5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rims1Q99NE5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rims1Q99NE5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rims1Q99NE5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rims1Q99NE5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rims1Q99NE5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rims1Q99NE5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rims1Q99NE5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rims1Q99NE5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rims1Q99NE5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Rims1Q99NE5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Rims1Q99NE5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Rims1Q99NE5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rims1Q99NE5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rims1Q99NE5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rims1Q99NE5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Rims1Q99NE5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rims1Q99NE5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rims1Q99NE5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Rims1Q99NE5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Rims1Q99NE5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rims1Q99NE5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rims1Q99NE5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Rims1Q99NE5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Rims1Q99NE5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Rims1Q99NE5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Rims1Q99NE5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Rims1Q99NE5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Rims1Q99NE5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Rims1Q99NE5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Rims1Q99NE5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.1 ms