Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rcbtb2Q99LJ7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rcbtb2Q99LJ7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rcbtb2Q99LJ7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rcbtb2Q99LJ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rcbtb2Q99LJ7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rcbtb2Q99LJ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rcbtb2Q99LJ7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rcbtb2Q99LJ7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rcbtb2Q99LJ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rcbtb2Q99LJ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rcbtb2Q99LJ7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rcbtb2Q99LJ7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rcbtb2Q99LJ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rcbtb2Q99LJ7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rcbtb2Q99LJ7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcbtb2Q99LJ7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rcbtb2Q99LJ7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rcbtb2Q99LJ7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rcbtb2Q99LJ7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rcbtb2Q99LJ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rcbtb2Q99LJ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcbtb2Q99LJ7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcbtb2Q99LJ7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcbtb2Q99LJ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rcbtb2Q99LJ7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rcbtb2Q99LJ7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rcbtb2Q99LJ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rcbtb2Q99LJ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rcbtb2Q99LJ7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rcbtb2Q99LJ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rcbtb2Q99LJ7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rcbtb2Q99LJ7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rcbtb2Q99LJ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rcbtb2Q99LJ7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rcbtb2Q99LJ7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rcbtb2Q99LJ7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rcbtb2Q99LJ7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rcbtb2Q99LJ7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rcbtb2Q99LJ7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rcbtb2Q99LJ7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rcbtb2Q99LJ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rcbtb2Q99LJ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rcbtb2Q99LJ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rcbtb2Q99LJ7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rcbtb2Q99LJ7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcbtb2Q99LJ7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcbtb2Q99LJ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcbtb2Q99LJ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rcbtb2Q99LJ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rcbtb2Q99LJ7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rcbtb2Q99LJ7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rcbtb2Q99LJ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rcbtb2Q99LJ7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rcbtb2Q99LJ7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rcbtb2Q99LJ7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rcbtb2Q99LJ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rcbtb2Q99LJ7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rcbtb2Q99LJ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rcbtb2Q99LJ7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rcbtb2Q99LJ7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rcbtb2Q99LJ7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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