Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdha8Q91Y12 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdha8Q91Y12 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdha8Q91Y12 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdha8Q91Y12 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdha8Q91Y12 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdha8Q91Y12 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha8Q91Y12 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha8Q91Y12 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha8Q91Y12 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdha8Q91Y12 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pcdha8Q91Y12 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha8Q91Y12 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcdha8Q91Y12 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha8Q91Y12 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha8Q91Y12 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcdha8Q91Y12 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdha8Q91Y12 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcdha8Q91Y12 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcdha8Q91Y12 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcdha8Q91Y12 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha8Q91Y12 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha8Q91Y12 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha8Q91Y12 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha8Q91Y12 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha8Q91Y12 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha8Q91Y12 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha8Q91Y12 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha8Q91Y12 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha8Q91Y12 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha8Q91Y12 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha8Q91Y12 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha8Q91Y12 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha8Q91Y12 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha8Q91Y12 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha8Q91Y12 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha8Q91Y12 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha8Q91Y12 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha8Q91Y12 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha8Q91Y12 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha8Q91Y12 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha8Q91Y12 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha8Q91Y12 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha8Q91Y12 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha8Q91Y12 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha8Q91Y12 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcdha8Q91Y12 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcdha8Q91Y12 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha8Q91Y12 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha8Q91Y12 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha8Q91Y12 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha8Q91Y12 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha8Q91Y12 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcdha8Q91Y12 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha8Q91Y12 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha8Q91Y12 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha8Q91Y12 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha8Q91Y12 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha8Q91Y12 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcdha8Q91Y12 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdha8Q91Y12 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdha8Q91Y12 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcdha8Q91Y12 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms