Protein–RNA interactions for Protein: Q91X84

Crtc3, CREB-regulated transcription coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crtc3Q91X84 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Crtc3Q91X84 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Crtc3Q91X84 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Crtc3Q91X84 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Crtc3Q91X84 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Crtc3Q91X84 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Crtc3Q91X84 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crtc3Q91X84 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crtc3Q91X84 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crtc3Q91X84 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Crtc3Q91X84 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crtc3Q91X84 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crtc3Q91X84 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crtc3Q91X84 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crtc3Q91X84 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crtc3Q91X84 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crtc3Q91X84 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crtc3Q91X84 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crtc3Q91X84 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crtc3Q91X84 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crtc3Q91X84 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crtc3Q91X84 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crtc3Q91X84 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crtc3Q91X84 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crtc3Q91X84 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crtc3Q91X84 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Crtc3Q91X84 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Crtc3Q91X84 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Crtc3Q91X84 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Crtc3Q91X84 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Crtc3Q91X84 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Crtc3Q91X84 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Crtc3Q91X84 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Crtc3Q91X84 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Crtc3Q91X84 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Crtc3Q91X84 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Crtc3Q91X84 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Crtc3Q91X84 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Crtc3Q91X84 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Crtc3Q91X84 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crtc3Q91X84 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Crtc3Q91X84 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Crtc3Q91X84 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Crtc3Q91X84 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Crtc3Q91X84 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Crtc3Q91X84 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Crtc3Q91X84 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Crtc3Q91X84 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Crtc3Q91X84 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Crtc3Q91X84 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crtc3Q91X84 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crtc3Q91X84 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Crtc3Q91X84 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Crtc3Q91X84 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crtc3Q91X84 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Crtc3Q91X84 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crtc3Q91X84 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crtc3Q91X84 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crtc3Q91X84 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crtc3Q91X84 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Crtc3Q91X84 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Crtc3Q91X84 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crtc3Q91X84 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crtc3Q91X84 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crtc3Q91X84 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Crtc3Q91X84 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Crtc3Q91X84 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crtc3Q91X84 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Crtc3Q91X84 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Crtc3Q91X84 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crtc3Q91X84 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crtc3Q91X84 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Crtc3Q91X84 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crtc3Q91X84 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Crtc3Q91X84 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Crtc3Q91X84 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crtc3Q91X84 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Crtc3Q91X84 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Crtc3Q91X84 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms