Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cbx7Q8VDS3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cbx7Q8VDS3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cbx7Q8VDS3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx7Q8VDS3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx7Q8VDS3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx7Q8VDS3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx7Q8VDS3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx7Q8VDS3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx7Q8VDS3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx7Q8VDS3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx7Q8VDS3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx7Q8VDS3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx7Q8VDS3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx7Q8VDS3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx7Q8VDS3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx7Q8VDS3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx7Q8VDS3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx7Q8VDS3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx7Q8VDS3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx7Q8VDS3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx7Q8VDS3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx7Q8VDS3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx7Q8VDS3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx7Q8VDS3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx7Q8VDS3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx7Q8VDS3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx7Q8VDS3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx7Q8VDS3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx7Q8VDS3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx7Q8VDS3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx7Q8VDS3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx7Q8VDS3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx7Q8VDS3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx7Q8VDS3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx7Q8VDS3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx7Q8VDS3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx7Q8VDS3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cbx7Q8VDS3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cbx7Q8VDS3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cbx7Q8VDS3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx7Q8VDS3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx7Q8VDS3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx7Q8VDS3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx7Q8VDS3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx7Q8VDS3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx7Q8VDS3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx7Q8VDS3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx7Q8VDS3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx7Q8VDS3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx7Q8VDS3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx7Q8VDS3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx7Q8VDS3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx7Q8VDS3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx7Q8VDS3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx7Q8VDS3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx7Q8VDS3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx7Q8VDS3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx7Q8VDS3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx7Q8VDS3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx7Q8VDS3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms