Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F8

Lsm14a, Protein LSM14 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm14aQ8K2F8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lsm14aQ8K2F8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lsm14aQ8K2F8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lsm14aQ8K2F8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lsm14aQ8K2F8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lsm14aQ8K2F8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lsm14aQ8K2F8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lsm14aQ8K2F8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lsm14aQ8K2F8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lsm14aQ8K2F8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lsm14aQ8K2F8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lsm14aQ8K2F8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lsm14aQ8K2F8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lsm14aQ8K2F8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lsm14aQ8K2F8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lsm14aQ8K2F8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lsm14aQ8K2F8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lsm14aQ8K2F8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lsm14aQ8K2F8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lsm14aQ8K2F8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsm14aQ8K2F8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsm14aQ8K2F8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsm14aQ8K2F8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lsm14aQ8K2F8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lsm14aQ8K2F8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lsm14aQ8K2F8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lsm14aQ8K2F8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lsm14aQ8K2F8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lsm14aQ8K2F8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lsm14aQ8K2F8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lsm14aQ8K2F8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lsm14aQ8K2F8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lsm14aQ8K2F8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Lsm14aQ8K2F8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lsm14aQ8K2F8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lsm14aQ8K2F8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lsm14aQ8K2F8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lsm14aQ8K2F8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lsm14aQ8K2F8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lsm14aQ8K2F8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lsm14aQ8K2F8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lsm14aQ8K2F8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lsm14aQ8K2F8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lsm14aQ8K2F8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lsm14aQ8K2F8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lsm14aQ8K2F8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lsm14aQ8K2F8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lsm14aQ8K2F8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lsm14aQ8K2F8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lsm14aQ8K2F8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lsm14aQ8K2F8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lsm14aQ8K2F8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lsm14aQ8K2F8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lsm14aQ8K2F8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lsm14aQ8K2F8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lsm14aQ8K2F8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lsm14aQ8K2F8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lsm14aQ8K2F8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lsm14aQ8K2F8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lsm14aQ8K2F8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lsm14aQ8K2F8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lsm14aQ8K2F8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lsm14aQ8K2F8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lsm14aQ8K2F8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lsm14aQ8K2F8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lsm14aQ8K2F8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lsm14aQ8K2F8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lsm14aQ8K2F8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lsm14aQ8K2F8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lsm14aQ8K2F8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lsm14aQ8K2F8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lsm14aQ8K2F8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lsm14aQ8K2F8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lsm14aQ8K2F8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lsm14aQ8K2F8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lsm14aQ8K2F8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lsm14aQ8K2F8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lsm14aQ8K2F8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lsm14aQ8K2F8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lsm14aQ8K2F8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lsm14aQ8K2F8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lsm14aQ8K2F8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lsm14aQ8K2F8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms