Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem17Q8K0U3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem17Q8K0U3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem17Q8K0U3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem17Q8K0U3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem17Q8K0U3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem17Q8K0U3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem17Q8K0U3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem17Q8K0U3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem17Q8K0U3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem17Q8K0U3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem17Q8K0U3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem17Q8K0U3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem17Q8K0U3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem17Q8K0U3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem17Q8K0U3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem17Q8K0U3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem17Q8K0U3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem17Q8K0U3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem17Q8K0U3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem17Q8K0U3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem17Q8K0U3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmem17Q8K0U3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem17Q8K0U3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem17Q8K0U3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem17Q8K0U3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem17Q8K0U3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem17Q8K0U3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem17Q8K0U3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem17Q8K0U3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem17Q8K0U3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem17Q8K0U3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem17Q8K0U3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem17Q8K0U3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem17Q8K0U3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem17Q8K0U3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmem17Q8K0U3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmem17Q8K0U3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmem17Q8K0U3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmem17Q8K0U3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem17Q8K0U3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem17Q8K0U3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmem17Q8K0U3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem17Q8K0U3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem17Q8K0U3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem17Q8K0U3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmem17Q8K0U3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem17Q8K0U3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem17Q8K0U3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem17Q8K0U3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem17Q8K0U3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem17Q8K0U3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem17Q8K0U3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem17Q8K0U3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem17Q8K0U3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem17Q8K0U3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem17Q8K0U3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem17Q8K0U3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem17Q8K0U3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem17Q8K0U3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem17Q8K0U3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem17Q8K0U3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem17Q8K0U3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem17Q8K0U3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem17Q8K0U3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem17Q8K0U3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem17Q8K0U3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem17Q8K0U3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem17Q8K0U3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem17Q8K0U3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem17Q8K0U3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem17Q8K0U3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem17Q8K0U3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmem17Q8K0U3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem17Q8K0U3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem17Q8K0U3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem17Q8K0U3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem17Q8K0U3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem17Q8K0U3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem17Q8K0U3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem17Q8K0U3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem17Q8K0U3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem17Q8K0U3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms