Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cpne5Q8JZW4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cpne5Q8JZW4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpne5Q8JZW4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpne5Q8JZW4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Cpne5Q8JZW4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpne5Q8JZW4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpne5Q8JZW4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpne5Q8JZW4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpne5Q8JZW4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpne5Q8JZW4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpne5Q8JZW4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpne5Q8JZW4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpne5Q8JZW4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpne5Q8JZW4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpne5Q8JZW4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpne5Q8JZW4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cpne5Q8JZW4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpne5Q8JZW4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpne5Q8JZW4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpne5Q8JZW4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpne5Q8JZW4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpne5Q8JZW4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpne5Q8JZW4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne5Q8JZW4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne5Q8JZW4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne5Q8JZW4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpne5Q8JZW4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpne5Q8JZW4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpne5Q8JZW4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpne5Q8JZW4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpne5Q8JZW4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpne5Q8JZW4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpne5Q8JZW4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpne5Q8JZW4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpne5Q8JZW4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpne5Q8JZW4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpne5Q8JZW4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpne5Q8JZW4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpne5Q8JZW4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpne5Q8JZW4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpne5Q8JZW4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne5Q8JZW4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne5Q8JZW4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne5Q8JZW4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne5Q8JZW4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne5Q8JZW4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpne5Q8JZW4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpne5Q8JZW4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpne5Q8JZW4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpne5Q8JZW4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne5Q8JZW4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne5Q8JZW4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne5Q8JZW4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpne5Q8JZW4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne5Q8JZW4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne5Q8JZW4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cpne5Q8JZW4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpne5Q8JZW4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpne5Q8JZW4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cpne5Q8JZW4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpne5Q8JZW4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpne5Q8JZW4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms