Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZS0

Lin7a, Protein lin-7 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin7aQ8JZS0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lin7aQ8JZS0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lin7aQ8JZS0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lin7aQ8JZS0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lin7aQ8JZS0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lin7aQ8JZS0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lin7aQ8JZS0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lin7aQ8JZS0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lin7aQ8JZS0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lin7aQ8JZS0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lin7aQ8JZS0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lin7aQ8JZS0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lin7aQ8JZS0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lin7aQ8JZS0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lin7aQ8JZS0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lin7aQ8JZS0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lin7aQ8JZS0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lin7aQ8JZS0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lin7aQ8JZS0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lin7aQ8JZS0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lin7aQ8JZS0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lin7aQ8JZS0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lin7aQ8JZS0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lin7aQ8JZS0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lin7aQ8JZS0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lin7aQ8JZS0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lin7aQ8JZS0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lin7aQ8JZS0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lin7aQ8JZS0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lin7aQ8JZS0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lin7aQ8JZS0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lin7aQ8JZS0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lin7aQ8JZS0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lin7aQ8JZS0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lin7aQ8JZS0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lin7aQ8JZS0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lin7aQ8JZS0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lin7aQ8JZS0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lin7aQ8JZS0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lin7aQ8JZS0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lin7aQ8JZS0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lin7aQ8JZS0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lin7aQ8JZS0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lin7aQ8JZS0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lin7aQ8JZS0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lin7aQ8JZS0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lin7aQ8JZS0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lin7aQ8JZS0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lin7aQ8JZS0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lin7aQ8JZS0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lin7aQ8JZS0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lin7aQ8JZS0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lin7aQ8JZS0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lin7aQ8JZS0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lin7aQ8JZS0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lin7aQ8JZS0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lin7aQ8JZS0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lin7aQ8JZS0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lin7aQ8JZS0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lin7aQ8JZS0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lin7aQ8JZS0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lin7aQ8JZS0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lin7aQ8JZS0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lin7aQ8JZS0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lin7aQ8JZS0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lin7aQ8JZS0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lin7aQ8JZS0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lin7aQ8JZS0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lin7aQ8JZS0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lin7aQ8JZS0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lin7aQ8JZS0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lin7aQ8JZS0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lin7aQ8JZS0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Lin7aQ8JZS0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lin7aQ8JZS0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Lin7aQ8JZS0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lin7aQ8JZS0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lin7aQ8JZS0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lin7aQ8JZS0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lin7aQ8JZS0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lin7aQ8JZS0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lin7aQ8JZS0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lin7aQ8JZS0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lin7aQ8JZS0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lin7aQ8JZS0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lin7aQ8JZS0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lin7aQ8JZS0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lin7aQ8JZS0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lin7aQ8JZS0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lin7aQ8JZS0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lin7aQ8JZS0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lin7aQ8JZS0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lin7aQ8JZS0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lin7aQ8JZS0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lin7aQ8JZS0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lin7aQ8JZS0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lin7aQ8JZS0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lin7aQ8JZS0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lin7aQ8JZS0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lin7aQ8JZS0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms