Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf628Q8CJ78 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf628Q8CJ78 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf628Q8CJ78 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf628Q8CJ78 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf628Q8CJ78 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf628Q8CJ78 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf628Q8CJ78 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf628Q8CJ78 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf628Q8CJ78 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf628Q8CJ78 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf628Q8CJ78 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf628Q8CJ78 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf628Q8CJ78 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf628Q8CJ78 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf628Q8CJ78 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf628Q8CJ78 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf628Q8CJ78 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf628Q8CJ78 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf628Q8CJ78 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf628Q8CJ78 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Znf628Q8CJ78 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf628Q8CJ78 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf628Q8CJ78 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf628Q8CJ78 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf628Q8CJ78 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf628Q8CJ78 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf628Q8CJ78 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf628Q8CJ78 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf628Q8CJ78 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf628Q8CJ78 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf628Q8CJ78 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf628Q8CJ78 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf628Q8CJ78 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf628Q8CJ78 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf628Q8CJ78 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf628Q8CJ78 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf628Q8CJ78 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf628Q8CJ78 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf628Q8CJ78 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf628Q8CJ78 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf628Q8CJ78 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf628Q8CJ78 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf628Q8CJ78 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf628Q8CJ78 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf628Q8CJ78 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf628Q8CJ78 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Znf628Q8CJ78 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf628Q8CJ78 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf628Q8CJ78 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf628Q8CJ78 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf628Q8CJ78 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf628Q8CJ78 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf628Q8CJ78 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf628Q8CJ78 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf628Q8CJ78 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf628Q8CJ78 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf628Q8CJ78 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf628Q8CJ78 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf628Q8CJ78 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf628Q8CJ78 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf628Q8CJ78 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf628Q8CJ78 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf628Q8CJ78 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf628Q8CJ78 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf628Q8CJ78 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf628Q8CJ78 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf628Q8CJ78 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf628Q8CJ78 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf628Q8CJ78 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Znf628Q8CJ78 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf628Q8CJ78 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf628Q8CJ78 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Znf628Q8CJ78 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf628Q8CJ78 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Znf628Q8CJ78 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Znf628Q8CJ78 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf628Q8CJ78 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Znf628Q8CJ78 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf628Q8CJ78 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Znf628Q8CJ78 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Znf628Q8CJ78 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf628Q8CJ78 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf628Q8CJ78 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf628Q8CJ78 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Znf628Q8CJ78 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf628Q8CJ78 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Znf628Q8CJ78 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Znf628Q8CJ78 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf628Q8CJ78 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf628Q8CJ78 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf628Q8CJ78 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Znf628Q8CJ78 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf628Q8CJ78 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf628Q8CJ78 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf628Q8CJ78 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Znf628Q8CJ78 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Znf628Q8CJ78 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf628Q8CJ78 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Znf628Q8CJ78 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms