Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nhlrc3Q8CCH2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nhlrc3Q8CCH2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nhlrc3Q8CCH2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nhlrc3Q8CCH2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nhlrc3Q8CCH2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nhlrc3Q8CCH2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nhlrc3Q8CCH2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlrc3Q8CCH2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nhlrc3Q8CCH2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nhlrc3Q8CCH2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nhlrc3Q8CCH2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nhlrc3Q8CCH2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nhlrc3Q8CCH2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nhlrc3Q8CCH2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nhlrc3Q8CCH2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nhlrc3Q8CCH2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nhlrc3Q8CCH2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nhlrc3Q8CCH2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nhlrc3Q8CCH2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nhlrc3Q8CCH2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nhlrc3Q8CCH2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nhlrc3Q8CCH2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nhlrc3Q8CCH2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nhlrc3Q8CCH2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nhlrc3Q8CCH2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nhlrc3Q8CCH2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nhlrc3Q8CCH2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nhlrc3Q8CCH2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nhlrc3Q8CCH2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nhlrc3Q8CCH2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nhlrc3Q8CCH2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nhlrc3Q8CCH2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nhlrc3Q8CCH2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nhlrc3Q8CCH2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlrc3Q8CCH2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nhlrc3Q8CCH2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nhlrc3Q8CCH2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nhlrc3Q8CCH2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nhlrc3Q8CCH2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nhlrc3Q8CCH2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nhlrc3Q8CCH2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms