Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Q8C5C9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q8C5C9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q8C5C9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q8C5C9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q8C5C9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q8C5C9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Q8C5C9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Q8C5C9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q8C5C9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q8C5C9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q8C5C9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q8C5C9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q8C5C9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q8C5C9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q8C5C9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q8C5C9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q8C5C9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q8C5C9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q8C5C9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q8C5C9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Q8C5C9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Q8C5C9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Q8C5C9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Q8C5C9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Q8C5C9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Q8C5C9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Q8C5C9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Q8C5C9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q8C5C9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Q8C5C9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q8C5C9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q8C5C9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q8C5C9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q8C5C9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q8C5C9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q8C5C9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Q8C5C9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q8C5C9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q8C5C9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q8C5C9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q8C5C9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q8C5C9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q8C5C9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q8C5C9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q8C5C9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q8C5C9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q8C5C9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Q8C5C9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Q8C5C9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Q8C5C9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q8C5C9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q8C5C9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q8C5C9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Q8C5C9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Q8C5C9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q8C5C9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Q8C5C9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q8C5C9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Q8C5C9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Q8C5C9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q8C5C9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q8C5C9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Q8C5C9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q8C5C9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Q8C5C9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q8C5C9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Q8C5C9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q8C5C9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Q8C5C9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Q8C5C9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q8C5C9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q8C5C9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q8C5C9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Q8C5C9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Q8C5C9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q8C5C9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q8C5C9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q8C5C9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q8C5C9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q8C5C9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Q8C5C9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q8C5C9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Q8C5C9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q8C5C9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q8C5C9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Q8C5C9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Q8C5C9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Q8C5C9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q8C5C9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q8C5C9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q8C5C9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q8C5C9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q8C5C9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q8C5C9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q8C5C9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q8C5C9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q8C5C9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q8C5C9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Q8C5C9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
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