Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Catsper4Q8BVN3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Catsper4Q8BVN3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Catsper4Q8BVN3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Catsper4Q8BVN3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Catsper4Q8BVN3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Catsper4Q8BVN3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Catsper4Q8BVN3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Catsper4Q8BVN3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Catsper4Q8BVN3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Catsper4Q8BVN3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Catsper4Q8BVN3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Catsper4Q8BVN3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Catsper4Q8BVN3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Catsper4Q8BVN3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Catsper4Q8BVN3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Catsper4Q8BVN3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Catsper4Q8BVN3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Catsper4Q8BVN3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Catsper4Q8BVN3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Catsper4Q8BVN3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Catsper4Q8BVN3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Catsper4Q8BVN3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Catsper4Q8BVN3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Catsper4Q8BVN3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Catsper4Q8BVN3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Catsper4Q8BVN3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Catsper4Q8BVN3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Catsper4Q8BVN3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Catsper4Q8BVN3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Catsper4Q8BVN3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Catsper4Q8BVN3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Catsper4Q8BVN3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Catsper4Q8BVN3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Catsper4Q8BVN3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Catsper4Q8BVN3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Catsper4Q8BVN3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Catsper4Q8BVN3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Catsper4Q8BVN3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Catsper4Q8BVN3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Catsper4Q8BVN3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Catsper4Q8BVN3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Catsper4Q8BVN3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Catsper4Q8BVN3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Catsper4Q8BVN3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Catsper4Q8BVN3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Catsper4Q8BVN3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Catsper4Q8BVN3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Catsper4Q8BVN3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Catsper4Q8BVN3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Catsper4Q8BVN3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Catsper4Q8BVN3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Catsper4Q8BVN3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Catsper4Q8BVN3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Catsper4Q8BVN3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Catsper4Q8BVN3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Catsper4Q8BVN3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Catsper4Q8BVN3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Catsper4Q8BVN3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Catsper4Q8BVN3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Catsper4Q8BVN3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Catsper4Q8BVN3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Catsper4Q8BVN3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Catsper4Q8BVN3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Catsper4Q8BVN3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Catsper4Q8BVN3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Catsper4Q8BVN3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Catsper4Q8BVN3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Catsper4Q8BVN3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Catsper4Q8BVN3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Catsper4Q8BVN3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Catsper4Q8BVN3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Catsper4Q8BVN3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Catsper4Q8BVN3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Catsper4Q8BVN3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Catsper4Q8BVN3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Catsper4Q8BVN3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Catsper4Q8BVN3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Catsper4Q8BVN3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Catsper4Q8BVN3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Catsper4Q8BVN3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Catsper4Q8BVN3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Catsper4Q8BVN3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Catsper4Q8BVN3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Catsper4Q8BVN3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Catsper4Q8BVN3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Catsper4Q8BVN3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Catsper4Q8BVN3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Catsper4Q8BVN3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Catsper4Q8BVN3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Catsper4Q8BVN3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Catsper4Q8BVN3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Catsper4Q8BVN3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Catsper4Q8BVN3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Catsper4Q8BVN3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Catsper4Q8BVN3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Catsper4Q8BVN3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Catsper4Q8BVN3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Catsper4Q8BVN3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Catsper4Q8BVN3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms